46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1592 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1592  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  185  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.488215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4543  PilT protein domain protein  82.46 
 
 		 136 aa  97.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1602  PilT protein-like  85.19 
 
 		 135 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2084  PilT protein-like protein  69.23 
 
 		 135 aa  73.9  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.236876  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1213  PilT domain-containing protein  60 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.401096 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4008  putative PilT-like protein  59.57 
 
 		 163 aa  57  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4182  PilT domain-containing protein  73.53 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3333  PilT domain-containing protein  73.53 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4833  PilT protein-like  73.53 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3163  PilT protein domain protein  68.57 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.732092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0679  putative plasmid stability protein  73.53 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.536522  normal  0.93191 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2873  PilT protein domain protein  64.86 
 
 		 135 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3346  PilT protein-like  60 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.732175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3079  PilT protein-like  57.14 
 
 		 146 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.046913  normal  0.55485 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2039  PilT domain-containing protein  71.43 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.837298  normal  0.704455 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1999  PIN domain protein  40.48 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0463072  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3418  PilT protein, N-terminal  40.48 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.317439  normal  0.0554428 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1397  PilT protein-like  38.55 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00639192  normal  0.0193425 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4565  PilT protein domain protein  64.86 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2839  nucleic acid-binding protein contains PIN domain  56.76 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.454124  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5837  PilT domain-containing protein  46.3 
 
 		 136 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.380144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3903  PilT protein-like  46.3 
 
 		 136 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4465  PilT domain-containing protein  46.3 
 
 		 136 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0857  PilT protein  62.16 
 
 		 140 aa  47.8  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.159356 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3902  PilT domain-containing protein  48.15 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4364  PilT domain-containing protein  48.15 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1430  hypothetical protein  46.3 
 
 		 117 aa  47  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.87225  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6277  PilT protein domain protein  35.11 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.466445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2534  PilT protein, N-terminal  55.88 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.641844  normal  0.62652 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2539  PilT domain-containing protein  44.23 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2919  PilT protein domain protein  64.71 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3962  PilT domain-containing protein  48 
 
 		 137 aa  43.9  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1997 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1511  hypothetical protein  52.38 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.162159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0505  putative plasmid stability protein  37.36 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2733  PilT protein-like  38.89 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.489446  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1400  PilT protein domain protein  55.88 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.310156 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5884  PilT domain-containing protein  60 
 
 		 148 aa  41.6  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.669409 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2018  PilT domain-containing protein  42.62 
 
 		 145 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0657956  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0871  putative plasmid stability-like protein  40.38 
 
 		 137 aa  41.6  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.852163  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1823  PilT domain-containing protein  48.89 
 
 		 142 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0091  PilT protein-like  55.56 
 
 		 144 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9108  pilT protein, N-terminal  44.68 
 
 		 143 aa  41.2  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2934  PilT protein-like  47.92 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.119744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6219  PilT protein domain protein  58.33 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.314877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1526  PilT protein domain protein  47.06 
 
 		 138 aa  40.8  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2795  PilT domain-containing protein  48.84 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.517688  normal  0.128803 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>