32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1511 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1511  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  174  4e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.162159  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1999  PIN domain protein  54 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0463072  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4008  putative PilT-like protein  44.64 
 
 		 163 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3418  PilT protein, N-terminal  63.89 
 
 		 150 aa  47  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.317439  normal  0.0554428 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1823  PilT domain-containing protein  60 
 
 		 142 aa  46.2  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1430  hypothetical protein  62.86 
 
 		 117 aa  45.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.87225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0013  PilT protein-like  60 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0679  putative plasmid stability protein  61.76 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.536522  normal  0.93191 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4833  PilT protein-like  61.76 
 
 		 139 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4182  PilT domain-containing protein  61.76 
 
 		 139 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3333  PilT domain-containing protein  61.76 
 
 		 139 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4619  PilT domain-containing protein  44.68 
 
 		 159 aa  44.3  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4543  PilT protein domain protein  52.38 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1592  hypothetical protein  52.38 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.488215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0713  PilT domain-containing protein  53.66 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000185206  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2539  PilT domain-containing protein  52.63 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0871  putative plasmid stability-like protein  51.43 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.852163  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4364  PilT domain-containing protein  57.14 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2873  PilT protein domain protein  55.88 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5837  PilT domain-containing protein  57.14 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.380144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3163  PilT protein domain protein  61.76 
 
 		 139 aa  42  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.732092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4465  PilT domain-containing protein  57.14 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3902  PilT domain-containing protein  57.14 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3903  PilT protein-like  57.14 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2534  PilT protein, N-terminal  55.88 
 
 		 137 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.641844  normal  0.62652 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1602  PilT protein-like  50 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0624  PilT protein-like  54.29 
 
 		 141 aa  41.2  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.810517  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2039  PilT domain-containing protein  58.82 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.837298  normal  0.704455 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1213  PilT domain-containing protein  51.22 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.401096 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0505  putative plasmid stability protein  42.86 
 
 		 145 aa  40.8  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4565  PilT protein domain protein  61.76 
 
 		 140 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2839  nucleic acid-binding protein contains PIN domain  58.82 
 
 		 140 aa  40  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.454124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>