97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0305 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0305  PilT protein domain protein  100 
 
 		 128 aa  261  2e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0032427  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1812  PilT domain-containing protein  60 
 
 		 132 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.034692  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1840  PilT domain-containing protein  41.27 
 
 		 135 aa  103  7e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1848  PilT protein domain protein  42.06 
 
 		 129 aa  93.2  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1337  PilT protein domain protein  40.65 
 
 		 129 aa  87.4  6e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.1325  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1904  PilT protein domain protein  36.51 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2936  PilT domain-containing protein  38.71 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.203821 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1067  PilT protein domain protein  34.65 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0898  PilT protein domain protein  43.3 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.185586  normal  0.0272728 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0688  PilT domain-containing protein  34.62 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0657  PilT protein domain protein  30.89 
 
 		 129 aa  62  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10607  hypothetical protein  32.26 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.353151 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4600  putative nitrogen regulatory protein (NtrR-like), putative virulence associated protein (vap)  39.23 
 
 		 135 aa  60.1  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.660475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0478  virulence-associated protein, putative  33.07 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0638  PilT protein domain protein  33.07 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0602  PilT protein domain protein  34.65 
 
 		 135 aa  57  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191075  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2669  PilT protein-like  29.84 
 
 		 132 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0691561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1484  hypothetical protein  31.78 
 
 		 141 aa  57  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.174904  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0038  PilT domain-containing protein  31.25 
 
 		 146 aa  57  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2777  PilT protein domain protein  33.59 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1063  PilT protein domain protein  29.37 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.471234  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2472  virulence associated protein C  34.11 
 
 		 133 aa  53.5  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00148493  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4028  PilT protein domain protein  32.84 
 
 		 141 aa  53.5  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2951  PilT domain-containing protein  32.31 
 
 		 136 aa  53.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3767  PilT domain-containing protein  32.59 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.546918  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1868  PilT domain-containing protein  34.11 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000212984  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1045  virulence-associated protein, putative  32.03 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.491192  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03915  predicted nucleic acid-binding protein,contains PIN domain  33.33 
 
 		 101 aa  52  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.968864  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10638  hypothetical protein  24.39 
 
 		 135 aa  50.8  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000594146  normal  0.603416 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1362  plasmid stability protein, putative  32.84 
 
 		 142 aa  50.4  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00298137  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4187  DNA replication protein-like protein  30.77 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1456  PilT protein domain protein  27.48 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.208651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0420  PilT protein domain protein  29.01 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4437  PilT protein-like  31.78 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0894  PilT protein, N-terminal  31.25 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1780  plasmid stability protein, putative  27.48 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3988  PilT protein domain protein  32.81 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0532731 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3889  PilT domain-containing protein  31.97 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3939  PilT protein domain protein  33.07 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1325  nucleic acid binding protein  32 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000354508  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0896  PilT protein-like  31.2 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1533  PilT protein domain protein  31.63 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0497484  hitchhiker  0.000597174 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3138  PilT protein-like  32.82 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.464533  normal  0.496916 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0728  PilT protein domain protein  34.4 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.741529  hitchhiker  0.0000801582 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1627  PilT protein domain protein  31.25 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.733144  normal  0.420461 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4076  plamid maintenance protein  30.77 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3942  PilT protein domain protein  25.74 
 
 		 152 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5182  PilT domain-containing protein  26.62 
 
 		 149 aa  47.8  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27524  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2302  plasmid stabilization protein  27.91 
 
 		 142 aa  47.4  0.00006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.171886  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3905  PilT domain-containing protein  30.71 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1433  NtrR protein  27.13 
 
 		 140 aa  47.4  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4014  PilT protein domain protein  30.3 
 
 		 137 aa  47  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00102621  hitchhiker  0.000259631 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2127  vapC protein, putative  29.37 
 
 		 133 aa  47  0.00009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4624  PilT domain-containing protein  27.34 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.723585  normal  0.112001 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0286  PilT protein domain protein  30 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.024358  decreased coverage  0.0024847 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4764  PilT domain-containing protein  30 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.310304 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1138  PilT domain-containing protein  35.05 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4819  PilT protein domain protein  30.95 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2332  PilT protein-like  31.3 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.221502 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0152  PilT protein domain protein  33.87 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7721  plasmid stability protein  32.09 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.859418 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2552  PilT domain-containing protein  29.46 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.748536  normal  0.0339823 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2617  nucleic acid binding protein  29.41 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.243477 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2505  PilT protein-like  29.63 
 
 		 147 aa  44.3  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00228638  normal  0.384652 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1183  PilT protein domain protein  29.91 
 
 		 119 aa  44.3  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3521  PilT domain-containing protein  32.5 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764562 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1214  PilT domain-containing protein  32.5 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2826  PilT protein-like  27.13 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640016  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3991  PilT protein domain protein  24.26 
 
 		 152 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.10183 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0630  PilT protein domain protein  30.83 
 
 		 137 aa  43.5  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.317071 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0983  PilT domain-containing protein  30 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3729  PilT protein-like  31.01 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5055  PilT domain-containing protein  32.28 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4019  PilT protein-like  29.1 
 
 		 144 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4710  PilT domain-containing protein  28 
 
 		 139 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1769  hypothetical protein  26.19 
 
 		 131 aa  42  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3269  PilT protein-like  35.56 
 
 		 133 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159462  hitchhiker  0.00995267 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1048  PilT protein domain protein  28.91 
 
 		 109 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.71366  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4425  PilT domain-containing protein  25.76 
 
 		 134 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042868 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1777  PilT domain-containing protein  28.89 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.406004  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0018  plasmid stability protein StbB  30.95 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0242004  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3455  PilT protein, N-terminal  33.61 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0624  PilT protein-like  27.34 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.810517  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1045  putative nucleic acid-binding protein  27.34 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.883513  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0442  nitrogen regulatory protein NtrR  29.01 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.315733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4188  PilT domain-containing protein  28 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.990127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6178  PilT protein, N-terminal  26.98 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.382745  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3968  PilT domain-containing protein  29.92 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.10464  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0926  hypothetical protein  33.87 
 
 		 207 aa  41.2  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.437058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0091  PilT domain-containing protein  30.47 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3267  plasmid maintenance protein  28.12 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0414  PilT protein domain protein  27.27 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3368  plasmid maintenance protein  28.12 
 
 		 133 aa  40.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2366  PilT protein domain protein  31.5 
 
 		 137 aa  40.4  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4619  PilT domain-containing protein  28.23 
 
 		 159 aa  40.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4575  PilT protein-like  30 
 
 		 137 aa  40.4  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4420  PilT protein domain protein  28.68 
 
 		 128 aa  40  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>