87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4124 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4124  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 128 aa  251  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113441  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3320  PilT protein-like  36.72 
 
 		 133 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1623  virulence associated protein VagD, putative  38.46 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0138  PilT domain-containing protein  36.72 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36180  PilT domain-containing protein  33.85 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1127  PilT domain-containing protein  35.94 
 
 		 133 aa  66.6  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.539233 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0154  PilT domain-containing protein  36.22 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2661  PilT domain-containing protein  37.88 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3905  PilT domain-containing protein  37.59 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2733  PilT protein-like  38.13 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.489446  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1533  PilT protein domain protein  32.58 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0497484  hitchhiker  0.000597174 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3682  PilT domain-containing protein  33.85 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.362926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2721  PilT protein-like protein  36.92 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.865953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0091  PilT domain-containing protein  35.34 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2468  PilT protein domain protein  30.56 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0500169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1868  PilT domain-containing protein  35.07 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000212984  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0152  PilT protein domain protein  36.92 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3757  PilT domain-containing protein  36.09 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272094  normal  0.0228653 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3732  nucleic acid-binding protein  32.58 
 
 		 132 aa  52.8  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2936  PilT domain-containing protein  35.11 
 
 		 130 aa  53.5  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.203821 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4589  PilT protein domain protein  31.16 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000022459  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0602  PilT protein domain protein  34.07 
 
 		 135 aa  51.6  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191075  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1319  PilT protein domain protein  34.62 
 
 		 140 aa  51.6  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5055  PilT domain-containing protein  34.33 
 
 		 133 aa  51.2  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1823  PilT domain-containing protein  33.81 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0728  PilT protein domain protein  31.85 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.741529  hitchhiker  0.0000801582 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0414  PilT protein domain protein  28.24 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4014  PilT protein domain protein  33.58 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00102621  hitchhiker  0.000259631 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2366  PilT protein domain protein  31.85 
 
 		 137 aa  50.4  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2659  nucleic acid binding protein  31.54 
 
 		 127 aa  50.4  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.234415  normal  0.629356 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2472  virulence associated protein C  31.88 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00148493  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0871  putative plasmid stability-like protein  34.88 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.852163  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0038  PilT domain-containing protein  31.62 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4109  PilT protein-like  36.59 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0058  PilT protein domain protein  35.48 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0552  PilT domain-containing protein  34.96 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2620  PilT protein domain protein  35.66 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4028  PilT protein domain protein  38.1 
 
 		 141 aa  47  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0630  PilT protein domain protein  35.07 
 
 		 137 aa  47  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.317071 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4257  PilT domain-containing protein  36.36 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.599841  hitchhiker  0.000155832 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4336  PilT protein-like  35.29 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.586249 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1433  NtrR protein  32.82 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0688  PilT domain-containing protein  31.58 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3124  hypothetical protein  38.24 
 
 		 141 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.864245 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0657  PilT protein domain protein  35.66 
 
 		 129 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1880  PilT-type plasmid stability protein  35.16 
 
 		 140 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0440  PilT protein-like  31.58 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000179252  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1063  PilT protein domain protein  30.43 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.471234  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2719  PilT protein-like  28.47 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.116591 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0857  PilT protein  33.59 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.159356 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0898  PilT protein domain protein  30 
 
 		 131 aa  43.5  0.0009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.185586  normal  0.0272728 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1114  nucleic acid binding protein  34.26 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1788  PilT protein domain protein  27.27 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.813085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0155  PilT protein domain protein  27.86 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.538447 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2129  virulence-associated protein, putative  27.27 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0156283  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2339  PilT protein domain protein  32.08 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4833  PilT protein-like  37.59 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3333  PilT domain-containing protein  37.59 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3558  PilT domain-containing protein  31.01 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1067  PilT protein domain protein  33.58 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1606  PilT protein domain protein  30.16 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4624  PilT domain-containing protein  27.48 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.723585  normal  0.112001 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4182  PilT domain-containing protein  37.59 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4565  PilT protein domain protein  35 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2534  PilT protein, N-terminal  30.65 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.641844  normal  0.62652 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4731  VagD  34.06 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.761951  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3697  PilT protein domain protein  35.77 
 
 		 138 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1362  plasmid stability protein, putative  35.56 
 
 		 142 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00298137  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3962  PilT domain-containing protein  34.35 
 
 		 137 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1997 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3163  PilT protein domain protein  32.81 
 
 		 139 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.732092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3418  PilT protein, N-terminal  31.85 
 
 		 150 aa  41.6  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.317439  normal  0.0554428 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1545  plasmid stabilization protein StbB-like  35.04 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00762824 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2839  nucleic acid-binding protein contains PIN domain  33.33 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.454124  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1663  PilT protein-like  30.23 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0881523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1632  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0286  PilT protein domain protein  29.1 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.024358  decreased coverage  0.0024847 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6255  PilT domain-containing protein  30.3 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0358672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2539  PilT domain-containing protein  32.35 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0151  PilT protein domain protein  35.09 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.85559  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23550  predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain protein  38.58 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.46968  normal  0.640927 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1397  PilT protein-like  36.23 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00639192  normal  0.0193425 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4437  PilT protein-like  31.62 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0679  putative plasmid stability protein  34.62 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.536522  normal  0.93191 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0442  nitrogen regulatory protein NtrR  30.53 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.315733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3212  PilT protein domain protein  40.86 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0181493  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1999  PIN domain protein  30.37 
 
 		 150 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0463072  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4019  PilT protein-like  34.53 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.506281 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>