34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_1632 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1632  PilT protein domain protein  100 
 
 		 141 aa  292  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1606  PilT protein domain protein  96.45 
 
 		 141 aa  283  7e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3124  hypothetical protein  33.57 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.864245 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5055  PilT domain-containing protein  26.06 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0701  PilT protein domain protein  28.47 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.528227 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1623  virulence associated protein VagD, putative  28.87 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0898  PilT protein domain protein  28.17 
 
 		 131 aa  51.2  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.185586  normal  0.0272728 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3905  PilT domain-containing protein  27.08 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3939  PilT protein domain protein  26.76 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4014  PilT protein domain protein  27.01 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00102621  hitchhiker  0.000259631 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2127  vapC protein, putative  28.67 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6255  PilT domain-containing protein  26.39 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0358672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0155  PilT protein domain protein  36.36 
 
 		 139 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.538447 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3757  PilT domain-containing protein  31.94 
 
 		 135 aa  47  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272094  normal  0.0228653 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8106  PilT protein domain protein  29.45 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3269  PilT protein-like  35 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159462  hitchhiker  0.00995267 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3988  PilT protein domain protein  25.87 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0532731 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2539  PilT domain-containing protein  28.06 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6878  PilT domain-containing protein  25.35 
 
 		 136 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.425666  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1533  PilT protein domain protein  26.06 
 
 		 132 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0497484  hitchhiker  0.000597174 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2661  PilT domain-containing protein  26.62 
 
 		 124 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1138  PilT domain-containing protein  31.43 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0286  PilT protein domain protein  27.46 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.024358  decreased coverage  0.0024847 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6277  PilT protein domain protein  26.24 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.466445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1063  PilT protein domain protein  23.78 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.471234  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0483  PilT domain-containing protein  27.46 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4589  PilT protein domain protein  25.17 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000022459  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0152  PilT protein domain protein  29.86 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4124  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113441  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2721  PilT protein-like protein  24.37 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.865953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0602  PilT protein domain protein  26.39 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191075  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2468  PilT protein domain protein  38.89 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0500169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0688  PilT domain-containing protein  24.65 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3729  PilT protein-like  27.78 
 
 		 133 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294534  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>