27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1606 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1606  PilT protein domain protein  100 
 
 		 141 aa  290  4e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1632  PilT protein domain protein  96.45 
 
 		 141 aa  283  7e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3124  hypothetical protein  31.47 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.864245 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0701  PilT protein domain protein  28.47 
 
 		 136 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.528227 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5055  PilT domain-containing protein  24.65 
 
 		 133 aa  50.8  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1623  virulence associated protein VagD, putative  28.17 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0898  PilT protein domain protein  27.46 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.185586  normal  0.0272728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4014  PilT protein domain protein  27.74 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00102621  hitchhiker  0.000259631 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3905  PilT domain-containing protein  27.08 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8106  PilT protein domain protein  28.77 
 
 		 138 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2127  vapC protein, putative  28.67 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3939  PilT protein domain protein  26.06 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1533  PilT protein domain protein  26.76 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0497484  hitchhiker  0.000597174 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0155  PilT protein domain protein  37.66 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.538447 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1138  PilT domain-containing protein  30 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3988  PilT protein domain protein  25.17 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0532731 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2539  PilT domain-containing protein  27.34 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2661  PilT domain-containing protein  26.62 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6277  PilT protein domain protein  27.34 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.466445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3269  PilT protein-like  33.33 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159462  hitchhiker  0.00995267 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0152  PilT protein domain protein  30.56 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4124  PilT domain-containing protein  30.16 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113441  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0483  PilT domain-containing protein  26.24 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0286  PilT protein domain protein  27.46 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.024358  decreased coverage  0.0024847 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1063  PilT protein domain protein  23.08 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.471234  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2721  PilT protein-like protein  24.37 
 
 		 125 aa  40.4  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.865953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4589  PilT protein domain protein  25.17 
 
 		 139 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000022459  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>