162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3682 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3682  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 134 aa  273  6e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.362926  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1623  virulence associated protein VagD, putative  60.45 
 
 		 134 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0138  PilT domain-containing protein  52.71 
 
 		 133 aa  142  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3320  PilT protein-like  51.94 
 
 		 133 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1127  PilT domain-containing protein  48.09 
 
 		 133 aa  133  7.000000000000001e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.539233 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36180  PilT domain-containing protein  48.48 
 
 		 136 aa  132  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0154  PilT domain-containing protein  51.94 
 
 		 133 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0091  PilT domain-containing protein  39.1 
 
 		 132 aa  95.5  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0478  virulence-associated protein, putative  42.96 
 
 		 134 aa  95.1  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0638  PilT protein domain protein  42.22 
 
 		 136 aa  93.6  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2661  PilT domain-containing protein  39.23 
 
 		 124 aa  92.8  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3905  PilT domain-containing protein  38.81 
 
 		 134 aa  90.5  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0602  PilT protein domain protein  38.64 
 
 		 135 aa  89.4  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191075  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0728  PilT protein domain protein  36.57 
 
 		 132 aa  90.1  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.741529  hitchhiker  0.0000801582 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1868  PilT domain-containing protein  36.36 
 
 		 133 aa  89  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000212984  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2669  PilT protein-like  37.88 
 
 		 132 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0691561  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2472  virulence associated protein C  36.36 
 
 		 133 aa  86.7  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00148493  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2951  PilT domain-containing protein  40.15 
 
 		 136 aa  86.3  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8106  PilT protein domain protein  38.41 
 
 		 138 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0688  PilT domain-containing protein  37.12 
 
 		 132 aa  84  6e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2777  PilT protein domain protein  37.04 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1325  nucleic acid binding protein  38.64 
 
 		 133 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000354508  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4624  PilT domain-containing protein  37.88 
 
 		 136 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.723585  normal  0.112001 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0440  PilT protein-like  35.82 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000179252  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3680  PilT protein domain protein  34.85 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2826  PilT protein-like  38.93 
 
 		 135 aa  77  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640016  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2129  virulence-associated protein, putative  36.3 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0156283  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0898  PilT protein domain protein  38.81 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.185586  normal  0.0272728 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1788  PilT protein domain protein  36.3 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.813085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3732  nucleic acid-binding protein  35.04 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2366  PilT protein domain protein  37.78 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4731  VagD  36.57 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.761951  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1045  virulence-associated protein, putative  33.33 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.491192  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0894  PilT protein, N-terminal  34.09 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0442  nitrogen regulatory protein NtrR  38.46 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.315733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1319  PilT protein domain protein  35.88 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1461  PilT protein domain protein  34.85 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2721  PilT protein-like protein  35.34 
 
 		 125 aa  72  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.865953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3729  PilT protein-like  33.59 
 
 		 133 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3558  PilT domain-containing protein  37.12 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4187  DNA replication protein-like protein  36.69 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0152  PilT protein domain protein  37.69 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1545  PilT domain-containing protein  40.44 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.230093  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6255  PilT domain-containing protein  38.06 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0358672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4076  plamid maintenance protein  35.29 
 
 		 135 aa  70.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2719  PilT protein-like  35.25 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.116591 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3267  plasmid maintenance protein  34.56 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1566  PilT domain-containing protein  40.6 
 
 		 140 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.123163  normal  0.225999 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3368  plasmid maintenance protein  34.56 
 
 		 133 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1063  PilT protein domain protein  37.78 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.471234  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6878  PilT domain-containing protein  38.06 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.425666  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4124  PilT domain-containing protein  33.85 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113441  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1876  PilT protein domain protein  35.66 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1433  NtrR protein  37.12 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3757  PilT domain-containing protein  37.23 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272094  normal  0.0228653 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0286  PilT protein domain protein  30.15 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.024358  decreased coverage  0.0024847 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0156  PilT protein domain protein  35.34 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4794  PilT protein-like  39.1 
 
 		 138 aa  67  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4014  PilT protein domain protein  33.82 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00102621  hitchhiker  0.000259631 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1771  hypothetical protein  31.34 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4147  PilT domain-containing protein  35.38 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.448502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1484  hypothetical protein  31.11 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.174904  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1533  PilT protein domain protein  34.09 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0497484  hitchhiker  0.000597174 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2597  PilT protein-like protein  34.31 
 
 		 133 aa  63.5  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0151  PilT protein domain protein  36.92 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.85559  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1769  hypothetical protein  31.78 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1627  PilT protein domain protein  32.84 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.733144  normal  0.420461 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2733  PilT protein-like  34.06 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.489446  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2552  PilT domain-containing protein  38.06 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.748536  normal  0.0339823 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0141  plasmid maintenance protein VagD  35.07 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2505  PilT protein domain protein  35.34 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4538  PilT protein domain protein  31.16 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.104439 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0017  PilT domain-containing protein  35.07 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.461831  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1067  PilT protein domain protein  34.07 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4581  PilT protein-like  32.86 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.766949  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5170  PilT protein domain protein  34.35 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0420  PilT protein domain protein  31.62 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4437  PilT protein-like  35.11 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0155  PilT protein domain protein  32.61 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.538447 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5262  PilT protein domain protein  31.65 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0679342  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2873  PilT protein domain protein  37.23 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5055  PilT domain-containing protein  32.59 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2061  PilT protein-like  34.81 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.464796 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03915  predicted nucleic acid-binding protein,contains PIN domain  34.69 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.968864  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4600  putative nitrogen regulatory protein (NtrR-like), putative virulence associated protein (vap)  37.4 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.660475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1213  virulence associated protein C  31.58 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1540  PilT protein domain protein  38.1 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0483  PilT domain-containing protein  34.81 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2534  PilT protein, N-terminal  34.11 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.641844  normal  0.62652 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0013  PilT protein-like  34.51 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1823  PilT domain-containing protein  30.94 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2468  PilT protein domain protein  30.6 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0500169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4589  PilT protein domain protein  30.88 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000022459  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2655  PIN domain protein  28.12 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0871  putative plasmid stability-like protein  31.88 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.852163  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1509  PilT domain-containing protein  32.43 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.203613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0414  PilT protein domain protein  29.77 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0234  PilT domain-containing protein  30.15 
 
 		 136 aa  53.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.749646 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0624  PilT protein-like  30.65 
 
 		 141 aa  52  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.810517  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0058  PilT protein domain protein  32.31 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>