31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3212 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_3212  PilT protein domain protein  100 
 
 		 128 aa  254  3e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0181493  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0552  PilT domain-containing protein  42.28 
 
 		 127 aa  81.6  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4109  PilT protein-like  43.09 
 
 		 127 aa  81.3  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5572  PilT domain-containing protein  39.52 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0396621  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1765  PilT protein domain protein  36.15 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0806025  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10607  hypothetical protein  36.28 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.353151 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3106  PilT domain-containing protein  42.62 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.194845  normal  0.285105 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0141  PilT protein-like  35.21 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4819  PilT protein domain protein  35.04 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1540  PilT protein domain protein  36.22 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3326  PilT domain-containing protein  36.57 
 
 		 143 aa  51.2  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0688  PilT domain-containing protein  28.1 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1127  PilT domain-containing protein  34.65 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.539233 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1545  plasmid stabilization protein StbB-like  34.38 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00762824 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3714  PilT protein domain protein  38.3 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0152  PilT protein domain protein  32.52 
 
 		 134 aa  47.4  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3729  PilT protein-like  30.16 
 
 		 133 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4396  PilT protein domain protein  37.01 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0074  PilT protein domain protein  27.54 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1138  PilT domain-containing protein  32.97 
 
 		 133 aa  44.3  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1362  plasmid stability protein, putative  35.56 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00298137  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4028  PilT protein domain protein  31.85 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0630  PilT protein domain protein  34.13 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.317071 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0638  PilT protein domain protein  29.37 
 
 		 136 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0478  virulence-associated protein, putative  29.37 
 
 		 134 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0038  PilT domain-containing protein  32.06 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2936  PilT domain-containing protein  31.09 
 
 		 130 aa  40.8  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.203821 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4124  PilT domain-containing protein  40.86 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113441  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3905  PilT domain-containing protein  31.15 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4147  PilT domain-containing protein  32.95 
 
 		 134 aa  40.4  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.448502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4710  PilT domain-containing protein  34.23 
 
 		 139 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.552962 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>