41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4819 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4819  PilT protein domain protein  100 
 
 
127 aa  247  3e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10638  hypothetical protein  49.14 
 
 
135 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000594146  normal  0.603416 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10607  hypothetical protein  41.54 
 
 
130 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.353151 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2016  hypothetical protein  49.53 
 
 
112 aa  74.7  0.0000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10678  hypothetical protein  46.46 
 
 
112 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4109  PilT protein-like  38.79 
 
 
127 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0552  PilT domain-containing protein  37.93 
 
 
127 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3106  PilT domain-containing protein  37.21 
 
 
127 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.194845  normal  0.285105 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0141  PilT protein-like  32.31 
 
 
157 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3212  PilT protein domain protein  35.04 
 
 
128 aa  57.8  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0181493  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0038  PilT domain-containing protein  34.15 
 
 
146 aa  57.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2150  PilT protein-like  39.62 
 
 
133 aa  53.9  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5572  PilT domain-containing protein  38.76 
 
 
126 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0396621  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4396  PilT protein domain protein  37.98 
 
 
125 aa  53.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0305  PilT protein domain protein  30.95 
 
 
128 aa  50.8  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0032427  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2505  PilT protein-like  29.91 
 
 
147 aa  50.8  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00228638  normal  0.384652 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2534  PilT protein, N-terminal  36.63 
 
 
137 aa  50.4  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.641844  normal  0.62652 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3714  PilT protein domain protein  34.11 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440396  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3326  PilT domain-containing protein  34.31 
 
 
143 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1848  PilT protein domain protein  29.17 
 
 
129 aa  47.4  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2620  PilT protein domain protein  35.43 
 
 
134 aa  45.4  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2873  PilT protein domain protein  36.17 
 
 
135 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1362  plasmid stability protein, putative  30.84 
 
 
142 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00298137  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1904  PilT protein domain protein  25.41 
 
 
129 aa  45.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4425  PilT domain-containing protein  33.85 
 
 
134 aa  44.7  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00042868 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8106  PilT protein domain protein  27.78 
 
 
138 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0354  PilT protein domain protein  34.71 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.279897  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1765  PilT protein domain protein  40.2 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0806025  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6878  PilT domain-containing protein  32.63 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.425666  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1337  PilT protein domain protein  26.5 
 
 
129 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.1325  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0657  PilT protein domain protein  31.63 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1812  PilT domain-containing protein  26.61 
 
 
132 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.034692  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1067  PilT protein domain protein  33.91 
 
 
134 aa  41.2  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0688  PilT domain-containing protein  25.21 
 
 
132 aa  41.2  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5884  PilT domain-containing protein  38.46 
 
 
148 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.669409 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3346  PilT protein-like  35.11 
 
 
146 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.732175  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0442  nitrogen regulatory protein NtrR  30.83 
 
 
134 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.315733  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1916  PilT protein-like  21.53 
 
 
144 aa  40.8  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3962  PilT domain-containing protein  34.86 
 
 
137 aa  40.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.1997 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3558  PilT domain-containing protein  30.11 
 
 
128 aa  40.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5841  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 
141 aa  40.4  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>