14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0354 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0354  PilT protein domain protein  100 
 
 		 134 aa  259  8.999999999999999e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.279897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2150  PilT protein-like  37.7 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4396  PilT protein domain protein  38.66 
 
 		 125 aa  51.2  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1765  PilT protein domain protein  34.45 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0806025  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1400  PilT protein domain protein  32.81 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.310156 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4109  PilT protein-like  32.77 
 
 		 127 aa  47.4  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0552  PilT domain-containing protein  32.77 
 
 		 127 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5572  PilT domain-containing protein  36.84 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0396621  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12844  hypothetical protein  31.75 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000370352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2839  nucleic acid-binding protein contains PIN domain  34.43 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.454124  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0141  PilT protein-like  40 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0442  nitrogen regulatory protein NtrR  35.29 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.315733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4819  PilT protein domain protein  32.5 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4147  PilT domain-containing protein  33.61 
 
 		 134 aa  40.4  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.448502  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>