64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1765 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1765  PilT protein domain protein  100 
 
 		 142 aa  273  5e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0806025  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3326  PilT domain-containing protein  64.08 
 
 		 143 aa  179  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0141  PilT protein-like  60.43 
 
 		 157 aa  157  7e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3714  PilT protein domain protein  50.74 
 
 		 139 aa  107  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0552  PilT domain-containing protein  40.15 
 
 		 127 aa  92  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4109  PilT protein-like  40.3 
 
 		 127 aa  90.1  9e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1540  PilT protein domain protein  43.18 
 
 		 137 aa  85.5  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5572  PilT domain-containing protein  43.51 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0396621  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3106  PilT domain-containing protein  44.96 
 
 		 127 aa  81.6  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.194845  normal  0.285105 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4396  PilT protein domain protein  40.15 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3212  PilT protein domain protein  37.69 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0181493  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3224  PilT domain-containing protein  51.61 
 
 		 100 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.418408 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0688  PilT domain-containing protein  34.65 
 
 		 132 aa  62  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2620  PilT protein domain protein  39.26 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2777  PilT protein domain protein  35.71 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2951  PilT domain-containing protein  37.3 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1325  nucleic acid binding protein  34.13 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000354508  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10638  hypothetical protein  35.07 
 
 		 135 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000594146  normal  0.603416 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1545  plasmid stabilization protein StbB-like  37.5 
 
 		 151 aa  52  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00762824 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0074  PilT protein domain protein  35.85 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0354  PilT protein domain protein  34.45 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.279897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1868  PilT domain-containing protein  33.07 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000212984  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1045  virulence-associated protein, putative  34.85 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.491192  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1623  virulence associated protein VagD, putative  36.84 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0638  PilT protein domain protein  31.58 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0478  virulence-associated protein, putative  31.58 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0894  PilT protein, N-terminal  34.85 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2669  PilT protein-like  32.54 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0691561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2150  PilT protein-like  37.96 
 
 		 133 aa  47  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5841  PilT domain-containing protein  33.06 
 
 		 141 aa  47  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3346  PilT protein-like  33.87 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.732175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2016  hypothetical protein  37.5 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2472  virulence associated protein C  33.86 
 
 		 133 aa  44.7  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00148493  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4624  PilT domain-containing protein  32.54 
 
 		 136 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.723585  normal  0.112001 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03915  predicted nucleic acid-binding protein,contains PIN domain  34.91 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.968864  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3269  PilT protein-like  41.25 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159462  hitchhiker  0.00995267 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1127  PilT domain-containing protein  33.86 
 
 		 133 aa  43.9  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.539233 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2129  virulence-associated protein, putative  32.81 
 
 		 136 aa  43.5  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0156283  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1788  PilT protein domain protein  32.81 
 
 		 136 aa  43.5  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.813085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4819  PilT protein domain protein  39.22 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1337  PilT protein domain protein  36.23 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.1325  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5170  PilT protein domain protein  31.25 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0152  PilT protein domain protein  36.03 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3079  PilT protein-like  32.73 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.046913  normal  0.55485 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3962  PilT domain-containing protein  32.81 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1997 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4076  plamid maintenance protein  34.92 
 
 		 135 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4575  PilT protein-like  35.56 
 
 		 137 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3474  PilT domain-containing protein  28.86 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1880  PilT-type plasmid stability protein  47.37 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4210  PilT domain-containing protein  35.51 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.242184  normal  0.98897 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2733  PilT protein-like  31.34 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.489446  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2873  PilT protein domain protein  30.61 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0444  PilT domain-containing protein  34.31 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1771  hypothetical protein  31.34 
 
 		 133 aa  40.8  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4543  PilT protein domain protein  37.37 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0469  PilT domain-containing protein  34.15 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4019  PilT protein-like  34.06 
 
 		 144 aa  40.4  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0701  PilT protein domain protein  31.11 
 
 		 136 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.528227 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0440  PilT protein-like  32.54 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000179252  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2534  PilT protein, N-terminal  29.41 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.641844  normal  0.62652 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0459  PilT protein domain protein  34.15 
 
 		 137 aa  40.4  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.063195 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4124  PilT domain-containing protein  37.3 
 
 		 128 aa  40  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113441  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3267  plasmid maintenance protein  32.54 
 
 		 132 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10607  hypothetical protein  32.23 
 
 		 130 aa  40  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.353151 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>