14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2150 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2150  PilT protein-like  100 
 
 		 133 aa  259  8e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4396  PilT protein domain protein  33.05 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0354  PilT protein domain protein  37.7 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.279897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4109  PilT protein-like  37.62 
 
 		 127 aa  53.5  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0552  PilT domain-containing protein  37.62 
 
 		 127 aa  53.5  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5572  PilT domain-containing protein  31.53 
 
 		 126 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0396621  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0141  PilT protein-like  36.17 
 
 		 157 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3714  PilT protein domain protein  36.78 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3106  PilT domain-containing protein  32.99 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.194845  normal  0.285105 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3326  PilT domain-containing protein  40.66 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1765  PilT protein domain protein  40.54 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0806025  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2016  hypothetical protein  38.75 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4819  PilT protein domain protein  41.57 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4147  PilT domain-containing protein  34.45 
 
 		 134 aa  40  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.448502  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>