73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3714 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3714  PilT protein domain protein  100 
 
 
139 aa  271  3e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440396  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3326  PilT domain-containing protein  49.65 
 
 
143 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0141  PilT protein-like  45.86 
 
 
157 aa  105  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1765  PilT protein domain protein  48.25 
 
 
142 aa  100  6e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0806025  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3224  PilT domain-containing protein  64.37 
 
 
100 aa  89.4  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.418408 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0552  PilT domain-containing protein  41.13 
 
 
127 aa  85.1  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4109  PilT protein-like  42.28 
 
 
127 aa  84.3  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1540  PilT protein domain protein  43.85 
 
 
137 aa  81.3  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5572  PilT domain-containing protein  43.08 
 
 
126 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0396621  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3106  PilT domain-containing protein  41.73 
 
 
127 aa  73.6  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.194845  normal  0.285105 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2620  PilT protein domain protein  37.31 
 
 
134 aa  65.1  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10638  hypothetical protein  42.28 
 
 
135 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000594146  normal  0.603416 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0286  PilT protein domain protein  31.58 
 
 
135 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.024358  decreased coverage  0.0024847 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4396  PilT protein domain protein  36.11 
 
 
125 aa  56.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1183  PilT protein domain protein  37.25 
 
 
119 aa  53.9  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0983  PilT domain-containing protein  32.82 
 
 
133 aa  53.5  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0074  PilT protein domain protein  34.11 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2016  hypothetical protein  44.16 
 
 
112 aa  53.1  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4019  PilT protein-like  33.58 
 
 
144 aa  50.8  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3939  PilT protein domain protein  34.17 
 
 
133 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0728  PilT protein domain protein  35.05 
 
 
132 aa  50.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.741529  hitchhiker  0.0000801582 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1823  PilT domain-containing protein  36.46 
 
 
142 aa  50.4  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402154  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2150  PilT protein-like  36.78 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2534  PilT protein, N-terminal  36.08 
 
 
137 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.641844  normal  0.62652 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3767  PilT domain-containing protein  35.65 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.546918  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1138  PilT domain-containing protein  34.51 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1127  PilT domain-containing protein  36.09 
 
 
133 aa  47.8  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.539233 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3212  PilT protein domain protein  38.3 
 
 
128 aa  47.8  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0181493  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5170  PilT protein domain protein  38.24 
 
 
147 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0985  PilT domain-containing protein  33 
 
 
129 aa  47.4  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.483809  normal  0.193625 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3269  PilT protein-like  34.62 
 
 
133 aa  47.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159462  hitchhiker  0.00995267 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4425  PilT domain-containing protein  37.38 
 
 
134 aa  47  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00042868 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5055  PilT domain-containing protein  34.69 
 
 
133 aa  47  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0602  PilT protein domain protein  33.09 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191075  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1433  PilT protein domain protein  43.1 
 
 
130 aa  45.4  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.697875  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1545  plasmid stabilization protein StbB-like  34.55 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00762824 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4014  PilT protein domain protein  34.34 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00102621  hitchhiker  0.000259631 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2039  PilT domain-containing protein  38 
 
 
140 aa  46.2  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.837298  normal  0.704455 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0091  PilT domain-containing protein  31.96 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4210  PilT domain-containing protein  38.46 
 
 
146 aa  45.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.242184  normal  0.98897 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4538  PilT protein domain protein  32.69 
 
 
140 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.104439 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3988  PilT protein domain protein  30.83 
 
 
133 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0532731 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2617  nucleic acid binding protein  33.33 
 
 
134 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.243477 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1777  PilT domain-containing protein  30.69 
 
 
143 aa  43.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.406004  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3163  PilT protein domain protein  34.59 
 
 
139 aa  42.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.732092  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36180  PilT domain-containing protein  32.33 
 
 
136 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0038  PilT domain-containing protein  30.77 
 
 
146 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0688  PilT domain-containing protein  30.83 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1048  PilT protein domain protein  40.58 
 
 
109 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.71366  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1623  virulence associated protein VagD, putative  37.37 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4028  PilT protein domain protein  32.35 
 
 
141 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1362  plasmid stability protein, putative  33.98 
 
 
142 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00298137  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2661  PilT domain-containing protein  36 
 
 
124 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6255  PilT domain-containing protein  31.06 
 
 
135 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0358672  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0701  PilT protein domain protein  30 
 
 
136 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.528227 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1771  hypothetical protein  27.34 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5262  PilT protein domain protein  30.77 
 
 
142 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0679342  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4420  PilT protein domain protein  30 
 
 
128 aa  41.6  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0138  PilT domain-containing protein  31.3 
 
 
133 aa  41.2  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4062  PilT protein domain protein  30.36 
 
 
155 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3757  PilT domain-containing protein  36.19 
 
 
135 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272094  normal  0.0228653 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3320  PilT protein-like  34.09 
 
 
133 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2498  PilT protein domain protein  32.67 
 
 
136 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0159803 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4042  PilT protein domain protein  30.36 
 
 
184 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.72027 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4819  PilT protein domain protein  37.04 
 
 
127 aa  40.4  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1045  virulence-associated protein, putative  37 
 
 
134 aa  40.4  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.491192  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1319  PilT protein domain protein  34.35 
 
 
140 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4543  PilT protein domain protein  49.06 
 
 
136 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1602  PilT protein-like  49.06 
 
 
135 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3346  PilT protein-like  37.38 
 
 
146 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.732175  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4336  PilT protein-like  33.65 
 
 
141 aa  40  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.586249 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0894  PilT protein, N-terminal  37 
 
 
134 aa  40.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1533  PilT protein domain protein  33.33 
 
 
132 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0497484  hitchhiker  0.000597174 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>