18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_2016 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_2016  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  216  1e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4819  PilT protein domain protein  49.53 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4109  PilT protein-like  42.59 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0552  PilT domain-containing protein  40.74 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10607  hypothetical protein  38.68 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.353151 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10638  hypothetical protein  46 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000594146  normal  0.603416 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3106  PilT domain-containing protein  40 
 
 		 127 aa  57  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.194845  normal  0.285105 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10678  hypothetical protein  40.95 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3714  PilT protein domain protein  44.16 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0141  PilT protein-like  33.9 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5572  PilT domain-containing protein  40 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0396621  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2150  PilT protein-like  38.75 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0459  PilT protein domain protein  35.45 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.063195 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3326  PilT domain-containing protein  33.04 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0602  PilT protein domain protein  31.48 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191075  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1765  PilT protein domain protein  37.5 
 
 		 142 aa  40.8  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0806025  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4014  PilT protein domain protein  30.23 
 
 		 137 aa  40.4  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00102621  hitchhiker  0.000259631 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0091  PilT domain-containing protein  26.13 
 
 		 132 aa  40  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>