72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5572 on replicon NC_009339
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009339  Mflv_5572  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 126 aa  242  9.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0396621  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0552  PilT domain-containing protein  63.2 
 
 		 127 aa  164  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4109  PilT protein-like  61.6 
 
 		 127 aa  159  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3106  PilT domain-containing protein  66.39 
 
 		 127 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.194845  normal  0.285105 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0141  PilT protein-like  42.34 
 
 		 157 aa  94.4  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3326  PilT domain-containing protein  45.11 
 
 		 143 aa  93.2  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4396  PilT protein domain protein  45.83 
 
 		 125 aa  89.4  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1765  PilT protein domain protein  46.97 
 
 		 142 aa  88.2  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0806025  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3714  PilT protein domain protein  43.08 
 
 		 139 aa  87.4  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1540  PilT protein domain protein  46.15 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3212  PilT protein domain protein  39.52 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0181493  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2620  PilT protein domain protein  36.84 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0038  PilT domain-containing protein  37.31 
 
 		 146 aa  67  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3697  PilT protein domain protein  42 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0354  PilT protein domain protein  39.47 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.279897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0478  virulence-associated protein, putative  36.64 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1623  virulence associated protein VagD, putative  33.59 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0638  PilT protein domain protein  35.88 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2016  hypothetical protein  40 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4470  ABC transporter related  64.29 
 
 		 183 aa  53.9  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10638  hypothetical protein  36.64 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000594146  normal  0.603416 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0688  PilT domain-containing protein  31.54 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4819  PilT protein domain protein  38.76 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2733  PilT protein-like  39.22 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.489446  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2150  PilT protein-like  33.04 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4538  PilT protein domain protein  39.18 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.104439 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2951  PilT domain-containing protein  34.68 
 
 		 136 aa  51.2  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1127  PilT domain-containing protein  37.25 
 
 		 133 aa  50.8  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.539233 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23550  predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain protein  37.88 
 
 		 142 aa  50.8  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.46968  normal  0.640927 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4575  PilT protein-like  40.95 
 
 		 137 aa  50.4  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10607  hypothetical protein  35.11 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.353151 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2472  virulence associated protein C  32.06 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00148493  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4210  PilT domain-containing protein  43 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.242184  normal  0.98897 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2936  PilT domain-containing protein  33.87 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.203821 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10678  hypothetical protein  37.25 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1823  PilT domain-containing protein  35.16 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5262  PilT protein domain protein  36.08 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0679342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0602  PilT protein domain protein  32.06 
 
 		 135 aa  47.8  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191075  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0728  PilT protein domain protein  34.31 
 
 		 132 aa  47  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.741529  hitchhiker  0.0000801582 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0091  PilT domain-containing protein  31.2 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4124  PilT domain-containing protein  35.77 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113441  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0630  PilT protein domain protein  33.07 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.317071 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6277  PilT protein domain protein  34.69 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.466445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4581  PilT protein-like  37.11 
 
 		 140 aa  44.3  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.766949  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1868  PilT domain-containing protein  29.6 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000212984  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2873  PilT protein domain protein  28.8 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36180  PilT domain-containing protein  34.38 
 
 		 136 aa  43.9  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3224  PilT domain-containing protein  36.89 
 
 		 100 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.418408 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1390  PilT domain-containing protein  43.43 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0155  PilT protein domain protein  29.32 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.538447 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1433  NtrR protein  31.93 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2039  PilT domain-containing protein  36.63 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.837298  normal  0.704455 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2339  PilT protein domain protein  32.33 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2539  PilT domain-containing protein  36.73 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4257  PilT domain-containing protein  40.17 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.599841  hitchhiker  0.000155832 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3939  PilT protein domain protein  31.73 
 
 		 133 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3585  PilT protein domain protein  31.58 
 
 		 129 aa  42  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2617  nucleic acid binding protein  50 
 
 		 134 aa  41.6  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.243477 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3905  PilT domain-containing protein  35.11 
 
 		 134 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2669  PilT protein-like  29.79 
 
 		 132 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0691561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0138  PilT domain-containing protein  33.66 
 
 		 133 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1063  PilT protein domain protein  36.11 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.471234  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2366  PilT protein domain protein  38.71 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0286  PilT protein domain protein  26.52 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.024358  decreased coverage  0.0024847 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1183  PilT protein domain protein  32.67 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2498  PilT protein domain protein  29.5 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0159803 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1213  PilT domain-containing protein  32.63 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.401096 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6402  PilT protein domain protein  34.75 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1533  PilT protein domain protein  33 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0497484  hitchhiker  0.000597174 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0013  PilT protein-like  39.81 
 
 		 140 aa  40.4  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1045  PilT domain-containing protein  30.58 
 
 		 139 aa  40  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0543043  normal  0.324928 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0857  PilT protein  32.35 
 
 		 140 aa  40  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.159356 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>