48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12844 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12844  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  266  7e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000370352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4717  PilT domain-containing protein  40.15 
 
 		 131 aa  84.7  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.603511 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4194  PilT domain-containing protein  40.15 
 
 		 131 aa  84.3  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.82082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3791  PilT domain-containing protein  39.39 
 
 		 131 aa  84  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0127598 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4269  PilT protein, N-terminal  35.61 
 
 		 136 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.692119  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2636  PilT protein-like  35.83 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1720  PilT protein domain protein  35.54 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0660  hypothetical protein  34.71 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.246636  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2220  PilT protein domain protein  32.23 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2398  PilT domain-containing protein  35.66 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1292  hypothetical protein  33.88 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1939  PilT protein domain protein  31.3 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2032  PilT domain-containing protein  36.51 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4312  PilT protein-like  31.4 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.693301  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4553  PilT protein-like  31.4 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0286007  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3503  hypothetical protein  33.61 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000000742258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1056  PilT protein domain protein  26.92 
 
 		 130 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0434852 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2712  PilT protein domain protein  35 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.162006  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0608  PilT protein domain protein  29.57 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.332384  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1745  hypothetical protein  31.19 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.111971 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0993  PilT protein-like  34.19 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00952696 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2268  PilT protein-like  30.95 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.375245  normal  0.653218 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1068  PilT protein domain protein  34.45 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.741251  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3632  PilT protein domain protein  30.25 
 
 		 129 aa  47.4  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0121  PilT protein domain protein  29.92 
 
 		 134 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0626  hypothetical protein  34.62 
 
 		 87 aa  47  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2909  PilT protein domain protein  29.91 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0354  PilT protein domain protein  31.75 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.279897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2455  PilT domain-containing protein  30.33 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1949  PilT protein domain protein  31.67 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1457  PilT protein domain protein  33.87 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.739604  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6309  hypothetical protein  34.55 
 
 		 125 aa  43.5  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31850  PIN domain family protein  27.05 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6344  PilT protein, N-terminal  30.43 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000192359  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2968  PilT domain-containing protein  30.16 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.691799 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2947  PilT domain-containing protein  30.16 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.438865  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2333  PilT protein-like  30.16 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0303174  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3315  PilT protein domain protein  31.09 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.424666  normal  0.500122 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00400  hypothetical protein  30.4 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0374839 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2224  PilT protein domain protein  30.95 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.292037 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3687  PilT domain-containing protein  34.78 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000701912 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6299  PilT protein-like  28.57 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00629  PilT protein domain protein  25.62 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000365497  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4379  PilT protein domain protein  29.27 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3367  PilT protein domain protein  32.03 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.014061 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2680  PilT protein domain protein  27.64 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4056  PilT domain-containing protein  32.56 
 
 		 128 aa  40.4  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0465  PilT domain-containing protein  27.73 
 
 		 125 aa  40.4  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0690648  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>