23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0121 on replicon NC_011885
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011885  Cyan7425_0121  PilT protein domain protein  100 
 
 
134 aa  263  8.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1457  PilT protein domain protein  40 
 
 
135 aa  89  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.739604  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4269  PilT protein, N-terminal  37.12 
 
 
136 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.692119  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3791  PilT domain-containing protein  37.12 
 
 
131 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0127598 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4717  PilT domain-containing protein  37.12 
 
 
131 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.603511 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4194  PilT domain-containing protein  37.12 
 
 
131 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.82082  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2636  PilT protein-like  36.36 
 
 
129 aa  74.7  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4684  hypothetical protein  35.29 
 
 
129 aa  65.5  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319794  normal  0.0555217 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2032  PilT domain-containing protein  32.35 
 
 
136 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4312  PilT protein-like  28.46 
 
 
142 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.693301  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4553  PilT protein-like  28.46 
 
 
142 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0286007  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12844  hypothetical protein  29.92 
 
 
134 aa  47  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000370352  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0593  PilT protein, N-terminal  34.83 
 
 
86 aa  47.4  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3439  PilT protein domain protein  30.83 
 
 
133 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0706  PilT domain-containing protein  28.93 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.816914  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00629  PilT protein domain protein  23.08 
 
 
128 aa  42.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000365497  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2220  PilT protein domain protein  25.69 
 
 
131 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0628  PilT domain-containing protein  28.93 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.478987  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3632  PilT protein domain protein  27.69 
 
 
129 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0818  hypothetical protein  29.55 
 
 
130 aa  42  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.550004  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3315  PilT protein domain protein  28.57 
 
 
133 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.424666  normal  0.500122 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2398  PilT domain-containing protein  29.77 
 
 
132 aa  40.4  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3715  PilT domain-containing protein  28.12 
 
 
128 aa  40.8  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0601342 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>