58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2398 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2398  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 132 aa  264  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2220  PilT protein domain protein  42.42 
 
 		 131 aa  100  8e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3791  PilT domain-containing protein  40.46 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0127598 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4717  PilT domain-containing protein  40.46 
 
 		 131 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.603511 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4194  PilT domain-containing protein  40.46 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.82082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1056  PilT protein domain protein  35.82 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0434852 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4269  PilT protein, N-terminal  32.82 
 
 		 136 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.692119  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2636  PilT protein-like  40.15 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12844  hypothetical protein  35.66 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000370352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1745  hypothetical protein  35.45 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.111971 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1720  PilT protein domain protein  35.38 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3715  PilT domain-containing protein  34.92 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0601342 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2032  PilT domain-containing protein  33.59 
 
 		 136 aa  57  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2333  PilT protein-like  32.84 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0303174  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2968  PilT domain-containing protein  32.84 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.691799 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2947  PilT domain-containing protein  32.84 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.438865  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3687  PilT domain-containing protein  35.34 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000701912 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0660  hypothetical protein  33.59 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.246636  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2268  PilT protein-like  37.04 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.375245  normal  0.653218 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1949  PilT protein domain protein  33.87 
 
 		 128 aa  53.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2680  PilT protein domain protein  36.09 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3632  PilT protein domain protein  30.15 
 
 		 129 aa  52  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0669  PilT protein domain protein  26.02 
 
 		 128 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1565  PilT domain-containing protein  31.58 
 
 		 128 aa  50.4  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0688  PilT protein domain protein  26.02 
 
 		 128 aa  50.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00227105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1939  PilT protein domain protein  30 
 
 		 134 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1068  PilT protein domain protein  39.06 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.741251  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0608  PilT protein domain protein  32.5 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.332384  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0280  hypothetical protein  29.85 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2909  PilT protein domain protein  32.54 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160929  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0465  PilT domain-containing protein  29.01 
 
 		 125 aa  46.2  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0690648  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1408  PilT protein domain protein  28.1 
 
 		 127 aa  46.2  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.748056  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1598  PilT protein domain protein  31.3 
 
 		 130 aa  45.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4089  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3315  PilT protein domain protein  32.52 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.424666  normal  0.500122 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3503  hypothetical protein  31.45 
 
 		 124 aa  45.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000000742258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0767  PilT protein-like  27.27 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.351411  normal  0.156815 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4056  PilT domain-containing protein  32.03 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4379  PilT protein domain protein  30 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6299  PilT protein-like  29.77 
 
 		 126 aa  44.3  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1428  PilT protein domain protein  28.15 
 
 		 132 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4312  PilT protein-like  29.47 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.693301  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4553  PilT protein-like  29.47 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0286007  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0109  hypothetical protein  31.62 
 
 		 128 aa  42.7  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0958283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0576  hypothetical protein  30.77 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0205  PilT protein domain protein  31.06 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.696325  normal  0.132115 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0413  PIN domain protein  30.77 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.688316  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2346  PilT protein domain protein  34.23 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3439  PilT protein domain protein  30.08 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0789  PilT domain-containing protein  31.01 
 
 		 128 aa  42  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31850  PIN domain family protein  29.1 
 
 		 125 aa  41.2  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1292  hypothetical protein  29.89 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2648  PilT domain-containing protein  32.26 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0721441 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0697  hypothetical protein  25.93 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.105307  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2455  PilT domain-containing protein  33.08 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4018  hypothetical protein  31.45 
 
 		 131 aa  40.8  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0121  PilT protein domain protein  29.77 
 
 		 134 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4539  PilT protein domain protein  29.46 
 
 		 128 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0047  PilT protein domain protein  29.23 
 
 		 128 aa  40.4  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>