106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2346 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2346  PilT protein domain protein  100 
 
 		 128 aa  258  1e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0789  PilT domain-containing protein  67.19 
 
 		 128 aa  172  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4539  PilT protein domain protein  62.5 
 
 		 128 aa  157  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4056  PilT domain-containing protein  60.16 
 
 		 128 aa  154  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0064  PilT domain-containing protein  60.94 
 
 		 128 aa  154  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.859731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0025  PilT protein-like  60.16 
 
 		 128 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0045  PilT domain-containing protein  60.16 
 
 		 128 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.368732  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2529  PilT protein domain protein  60 
 
 		 130 aa  150  5.9999999999999996e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4694  PilT domain-containing protein  61.9 
 
 		 109 aa  138  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.499917 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2422  hypothetical protein  57.26 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0993  PilT protein-like  53.12 
 
 		 128 aa  132  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00952696 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0198  PilT protein domain protein  52.8 
 
 		 128 aa  130  9e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.398764  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0576  hypothetical protein  51.64 
 
 		 125 aa  110  6e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0413  PIN domain protein  51.64 
 
 		 125 aa  110  6e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.688316  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1949  PilT protein domain protein  48.06 
 
 		 128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0628  PilT domain-containing protein  51.22 
 
 		 129 aa  107  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.478987  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0706  PilT domain-containing protein  52.03 
 
 		 129 aa  107  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.816914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6344  PilT protein, N-terminal  46.09 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000192359  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3824  PilT protein-like  50.41 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3678  hypothetical protein  56.38 
 
 		 94 aa  105  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.36052  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3367  PilT protein domain protein  46.4 
 
 		 124 aa  99.4  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.014061 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4379  PilT protein domain protein  45.45 
 
 		 125 aa  99  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2648  PilT domain-containing protein  47.97 
 
 		 129 aa  97.8  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0721441 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1573  PIN domain protein  46.09 
 
 		 128 aa  96.3  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31850  PIN domain family protein  43.44 
 
 		 125 aa  96.3  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6299  PilT protein-like  47.11 
 
 		 126 aa  95.9  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2442  PilT domain-containing protein  47.54 
 
 		 124 aa  95.9  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0388394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4018  hypothetical protein  45.8 
 
 		 131 aa  95.9  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3503  hypothetical protein  45.45 
 
 		 124 aa  95.9  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000000742258  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0109  hypothetical protein  44.8 
 
 		 128 aa  95.1  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0958283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00629  PilT protein domain protein  41.18 
 
 		 128 aa  95.1  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000365497  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2680  PilT protein domain protein  42.19 
 
 		 128 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2333  PilT protein-like  45.45 
 
 		 126 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0303174  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2947  PilT domain-containing protein  45.45 
 
 		 126 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.438865  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2968  PilT domain-containing protein  45.45 
 
 		 126 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.691799 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1428  PilT protein domain protein  40.65 
 
 		 132 aa  92.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2940  PilT domain-containing protein  42.37 
 
 		 129 aa  92  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.085873  normal  0.287636 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3439  PilT protein domain protein  41.94 
 
 		 133 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3715  PilT domain-containing protein  42.19 
 
 		 128 aa  90.9  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0601342 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2455  PilT domain-containing protein  44.63 
 
 		 125 aa  90.5  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1038  PilT domain-containing protein  42.5 
 
 		 128 aa  89.7  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.442383 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3315  PilT protein domain protein  40.32 
 
 		 133 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.424666  normal  0.500122 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1565  PilT domain-containing protein  39.68 
 
 		 128 aa  89.4  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2598  PilT domain-containing protein  41.86 
 
 		 124 aa  88.2  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0709656  normal  0.0156021 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1598  PilT protein domain protein  42.62 
 
 		 130 aa  88.2  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4089  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3632  PilT protein domain protein  41.13 
 
 		 129 aa  87.8  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0767  PilT protein-like  38.89 
 
 		 128 aa  87.4  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.351411  normal  0.156815 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0697  hypothetical protein  36.07 
 
 		 133 aa  87  8e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.105307  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3687  PilT domain-containing protein  46.34 
 
 		 128 aa  87  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000701912 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3737  PilT domain-containing protein  36.13 
 
 		 128 aa  85.5  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2183  hypothetical protein  61.76 
 
 		 71 aa  85.1  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.765275  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0047  PilT protein domain protein  43.08 
 
 		 128 aa  84.7  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2712  PilT protein domain protein  42.98 
 
 		 124 aa  84  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.162006  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4034  PilT protein-like  38.52 
 
 		 128 aa  83.6  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.507909 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4037  PilT domain-containing protein  38.71 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2387  PilT protein domain protein  39.34 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0277  hypothetical protein  35.48 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0011733  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4004  PilT protein domain protein  35.77 
 
 		 127 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000733921  hitchhiker  0.00000000266973 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0280  hypothetical protein  35.2 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0669  PilT protein domain protein  35.88 
 
 		 128 aa  79.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0688  PilT protein domain protein  35.88 
 
 		 128 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00227105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3327  PilT protein domain protein  40.68 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0465  PilT domain-containing protein  37.29 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0690648  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1572  PilT protein domain protein  40.5 
 
 		 125 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0205  PilT protein domain protein  38.4 
 
 		 128 aa  77.8  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.696325  normal  0.132115 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4043  PilT protein-like  34.43 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.280073  normal  0.218169 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4123  PilT protein domain protein  42.52 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.454937  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0671  PilT domain-containing protein  32.23 
 
 		 125 aa  75.1  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1408  PilT protein domain protein  34.71 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.748056  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1434  PilT protein-like  36.67 
 
 		 125 aa  73.6  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.536835  normal  0.658173 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00400  hypothetical protein  36.51 
 
 		 130 aa  73.6  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0374839 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2224  PilT protein domain protein  36.8 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.292037 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6684  PilT protein domain protein  33.87 
 
 		 132 aa  72  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.185489  normal  0.593771 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1187  PilT protein domain protein  36 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0967234  normal  0.700283 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1995  PilT domain-containing protein  40.98 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.691704  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4956  PilT protein domain protein  35.48 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00799325 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6309  hypothetical protein  34.78 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3328  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2995  PilT protein domain protein  35.94 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0565666  normal  0.167497 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3651  PilT protein domain protein  31.5 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2032  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 		 136 aa  57  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2734  PilT protein domain protein  34.71 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2909  PilT protein domain protein  36.52 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1939  PilT protein domain protein  30.33 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4269  PilT protein, N-terminal  33.87 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.692119  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4573  PilT protein domain protein  29.84 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.152026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1056  PilT protein domain protein  31.54 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0434852 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4312  PilT protein-like  32.26 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.693301  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4553  PilT protein-like  32.26 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0286007  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2398  PilT domain-containing protein  35.43 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3791  PilT domain-containing protein  34.65 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0127598 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2182  hypothetical protein  60.98 
 
 		 42 aa  52  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.931178  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1068  PilT protein domain protein  30.47 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.741251  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4717  PilT domain-containing protein  34.15 
 
 		 131 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.603511 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4194  PilT domain-containing protein  34.15 
 
 		 131 aa  51.2  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.82082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2268  PilT protein-like  33.6 
 
 		 136 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.375245  normal  0.653218 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5379  hypothetical protein  47.17 
 
 		 198 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0115  hypothetical protein  47.17 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.178636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1720  PilT protein domain protein  28.93 
 
 		 129 aa  45.1  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1745  hypothetical protein  27.27 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.111971 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>