100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0697 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0697  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  275  2e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.105307  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0277  hypothetical protein  58.02 
 
 
131 aa  172  1.9999999999999998e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0011733  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6344  PilT protein, N-terminal  39.53 
 
 
125 aa  97.8  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000192359  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4379  PilT protein domain protein  36.43 
 
 
125 aa  92.8  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1408  PilT protein domain protein  37.7 
 
 
127 aa  90.9  5e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.748056  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1949  PilT protein domain protein  33.07 
 
 
128 aa  88.6  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00629  PilT protein domain protein  37.4 
 
 
128 aa  87.8  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000365497  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0047  PilT protein domain protein  36.89 
 
 
128 aa  87.8  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3503  hypothetical protein  31.2 
 
 
124 aa  87  7e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000000742258  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0064  PilT domain-containing protein  35.25 
 
 
128 aa  87  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.859731  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1428  PilT protein domain protein  35.43 
 
 
132 aa  86.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2422  hypothetical protein  33.9 
 
 
128 aa  85.9  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0767  PilT protein-like  36.89 
 
 
128 aa  85.5  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.351411  normal  0.156815 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1573  PIN domain protein  31.06 
 
 
128 aa  85.5  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4056  PilT domain-containing protein  33.61 
 
 
128 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0789  PilT domain-containing protein  34.43 
 
 
128 aa  85.1  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0205  PilT protein domain protein  35.25 
 
 
128 aa  84.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.696325  normal  0.132115 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2455  PilT domain-containing protein  34.11 
 
 
125 aa  84.7  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0280  hypothetical protein  39.02 
 
 
128 aa  84.3  5e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0025  PilT protein-like  34.43 
 
 
128 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2680  PilT protein domain protein  37.7 
 
 
128 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0045  PilT domain-containing protein  34.43 
 
 
128 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.368732  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2442  PilT domain-containing protein  34.88 
 
 
124 aa  84.3  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0388394  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3715  PilT domain-containing protein  36.59 
 
 
128 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0601342 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4539  PilT protein domain protein  34.43 
 
 
128 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4043  PilT protein-like  32.52 
 
 
127 aa  81.6  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.280073  normal  0.218169 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4004  PilT protein domain protein  32.79 
 
 
127 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000733921  hitchhiker  0.00000000266973 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2598  PilT domain-containing protein  31.78 
 
 
124 aa  80.9  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0709656  normal  0.0156021 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0109  hypothetical protein  35.94 
 
 
128 aa  80.5  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0958283  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1038  PilT domain-containing protein  32.82 
 
 
128 aa  80.9  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.442383 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4956  PilT protein domain protein  33.86 
 
 
132 aa  80.5  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00799325 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0198  PilT protein domain protein  32.79 
 
 
128 aa  80.1  0.000000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.398764  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6684  PilT protein domain protein  33.07 
 
 
132 aa  80.1  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.185489  normal  0.593771 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2529  PilT protein domain protein  36.59 
 
 
130 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3824  PilT protein-like  32.26 
 
 
129 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4037  PilT domain-containing protein  33.86 
 
 
126 aa  78.6  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0669  PilT protein domain protein  33.61 
 
 
128 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0688  PilT protein domain protein  33.61 
 
 
128 aa  77.8  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00227105  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6299  PilT protein-like  34.13 
 
 
126 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4573  PilT protein domain protein  33.82 
 
 
136 aa  77.8  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.152026  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0628  PilT domain-containing protein  32.26 
 
 
129 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.478987  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1565  PilT domain-containing protein  32.82 
 
 
128 aa  77.8  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2387  PilT protein domain protein  34.43 
 
 
127 aa  77.4  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0413  PIN domain protein  29.6 
 
 
125 aa  77  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.688316  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0576  hypothetical protein  29.6 
 
 
125 aa  77  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2333  PilT protein-like  32.54 
 
 
126 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0303174  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2947  PilT domain-containing protein  32.54 
 
 
126 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.438865  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2968  PilT domain-containing protein  32.54 
 
 
126 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.691799 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0706  PilT domain-containing protein  31.45 
 
 
129 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.816914  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0993  PilT protein-like  31.15 
 
 
128 aa  76.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00952696 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3315  PilT protein domain protein  32.8 
 
 
133 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.424666  normal  0.500122 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31850  PIN domain family protein  32.56 
 
 
125 aa  75.5  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4018  hypothetical protein  30.3 
 
 
131 aa  75.5  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4123  PilT protein domain protein  35.77 
 
 
126 aa  75.9  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.454937  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2648  PilT domain-containing protein  32.2 
 
 
129 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0721441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4034  PilT protein-like  35.77 
 
 
128 aa  74.7  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.507909 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3439  PilT protein domain protein  32.8 
 
 
133 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3367  PilT protein domain protein  33.06 
 
 
124 aa  74.3  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.014061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2940  PilT domain-containing protein  32.23 
 
 
129 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.085873  normal  0.287636 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3687  PilT domain-containing protein  31.5 
 
 
128 aa  73.6  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000701912 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0465  PilT domain-containing protein  37.19 
 
 
125 aa  73.6  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0690648  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1434  PilT protein-like  34.4 
 
 
125 aa  72.8  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.536835  normal  0.658173 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1598  PilT protein domain protein  28.93 
 
 
130 aa  73.6  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4089  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1572  PilT protein domain protein  34.43 
 
 
125 aa  72.4  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2346  PilT protein domain protein  33.33 
 
 
128 aa  72  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3327  PilT protein domain protein  33.05 
 
 
131 aa  71.6  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2712  PilT protein domain protein  31.71 
 
 
124 aa  70.9  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.162006  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3632  PilT protein domain protein  26.02 
 
 
129 aa  70.5  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2224  PilT protein domain protein  31.15 
 
 
126 aa  69.7  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.292037 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1187  PilT protein domain protein  31.4 
 
 
132 aa  69.7  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0967234  normal  0.700283 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3328  PilT protein domain protein  27.35 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1995  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 
128 aa  68.2  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.691704  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0118  PilT protein-like protein  29.23 
 
 
127 aa  67  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3651  PilT protein domain protein  33.58 
 
 
136 aa  66.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3737  PilT domain-containing protein  28.24 
 
 
128 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00400  hypothetical protein  28.23 
 
 
130 aa  65.1  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0374839 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2995  PilT protein domain protein  31.45 
 
 
128 aa  63.9  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0565666  normal  0.167497 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0671  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2183  hypothetical protein  52.83 
 
 
71 aa  62.4  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.765275  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4694  PilT domain-containing protein  32.29 
 
 
109 aa  60.8  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.499917 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1056  PilT protein domain protein  32 
 
 
130 aa  60.1  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0434852 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3678  hypothetical protein  35.23 
 
 
94 aa  59.7  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.36052  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2734  PilT protein domain protein  30.65 
 
 
128 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180703  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6309  hypothetical protein  28.81 
 
 
125 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2268  PilT protein-like  32.31 
 
 
136 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.375245  normal  0.653218 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2909  PilT protein domain protein  32.26 
 
 
133 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160929  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5379  hypothetical protein  47.37 
 
 
198 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2032  PilT domain-containing protein  25.42 
 
 
136 aa  52  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1939  PilT protein domain protein  27.42 
 
 
134 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0660  hypothetical protein  28 
 
 
129 aa  46.6  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.246636  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4269  PilT protein, N-terminal  27.2 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.692119  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4553  PilT protein-like  26.15 
 
 
142 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0286007  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4312  PilT protein-like  26.15 
 
 
142 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.693301  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0608  PilT protein domain protein  26.02 
 
 
131 aa  42.7  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.332384  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2220  PilT protein domain protein  30.08 
 
 
131 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2398  PilT domain-containing protein  25.93 
 
 
132 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1292  hypothetical protein  25.2 
 
 
135 aa  40.8  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0115  hypothetical protein  38.18 
 
 
62 aa  40.8  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.178636  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1720  PilT protein domain protein  27.64 
 
 
129 aa  40  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1068  PilT protein domain protein  26.5 
 
 
133 aa  40  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.741251  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>