100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6684 on replicon NC_013731
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013731  Slin_6684  PilT protein domain protein  100 
 
 
132 aa  262  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.185489  normal  0.593771 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4956  PilT protein domain protein  89.39 
 
 
132 aa  237  4e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00799325 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0767  PilT protein-like  42.74 
 
 
128 aa  103  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.351411  normal  0.156815 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0628  PilT domain-containing protein  39.52 
 
 
129 aa  93.2  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.478987  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0706  PilT domain-containing protein  38.71 
 
 
129 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.816914  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3439  PilT protein domain protein  44.44 
 
 
133 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3824  PilT protein-like  37.9 
 
 
129 aa  92  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00629  PilT protein domain protein  37.9 
 
 
128 aa  92.4  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000365497  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0047  PilT protein domain protein  44.53 
 
 
128 aa  92  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31850  PIN domain family protein  43.18 
 
 
125 aa  92.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3315  PilT protein domain protein  44.44 
 
 
133 aa  92  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.424666  normal  0.500122 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4379  PilT protein domain protein  42.31 
 
 
125 aa  88.2  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2387  PilT protein domain protein  40.48 
 
 
127 aa  87.8  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3503  hypothetical protein  39.23 
 
 
124 aa  87.4  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000000742258  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0280  hypothetical protein  37.6 
 
 
128 aa  86.7  9e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3632  PilT protein domain protein  36.64 
 
 
129 aa  86.7  9e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0465  PilT domain-containing protein  41.8 
 
 
125 aa  86.7  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0690648  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2648  PilT domain-containing protein  36.29 
 
 
129 aa  86.3  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0721441 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2333  PilT protein-like  42.86 
 
 
126 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0303174  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1565  PilT domain-containing protein  38.4 
 
 
128 aa  85.5  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2947  PilT domain-containing protein  42.86 
 
 
126 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.438865  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2968  PilT domain-containing protein  42.86 
 
 
126 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.691799 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4034  PilT protein-like  39.2 
 
 
128 aa  84  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.507909 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4123  PilT protein domain protein  40.8 
 
 
126 aa  84  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.454937  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2680  PilT protein domain protein  33.87 
 
 
128 aa  83.6  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3715  PilT domain-containing protein  37.5 
 
 
128 aa  83.6  9e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0601342 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1428  PilT protein domain protein  39.2 
 
 
132 aa  82.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1038  PilT domain-containing protein  41.94 
 
 
128 aa  83.2  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.442383 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0198  PilT protein domain protein  35.11 
 
 
128 aa  82  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.398764  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3687  PilT domain-containing protein  35.2 
 
 
128 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000701912 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6344  PilT protein, N-terminal  42.19 
 
 
125 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000192359  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1408  PilT protein domain protein  37.21 
 
 
127 aa  81.6  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.748056  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1572  PilT protein domain protein  38.93 
 
 
125 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6299  PilT protein-like  42.06 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1949  PilT protein domain protein  35.88 
 
 
128 aa  80.9  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0669  PilT protein domain protein  35.48 
 
 
128 aa  80.5  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1434  PilT protein-like  37.6 
 
 
125 aa  79.7  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.536835  normal  0.658173 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0697  hypothetical protein  33.07 
 
 
133 aa  80.1  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.105307  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0688  PilT protein domain protein  35.48 
 
 
128 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00227105  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1598  PilT protein domain protein  36.07 
 
 
130 aa  79  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4089  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4573  PilT protein domain protein  37.9 
 
 
136 aa  79.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.152026  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3737  PilT domain-containing protein  39.02 
 
 
128 aa  78.2  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0413  PIN domain protein  32.8 
 
 
125 aa  77.8  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.688316  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0576  hypothetical protein  32.8 
 
 
125 aa  77.8  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4056  PilT domain-containing protein  35.48 
 
 
128 aa  77.4  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1995  PilT domain-containing protein  38.71 
 
 
128 aa  77  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.691704  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4004  PilT protein domain protein  37.01 
 
 
127 aa  77.4  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000733921  hitchhiker  0.00000000266973 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2442  PilT domain-containing protein  37.1 
 
 
124 aa  76.6  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0388394  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3367  PilT protein domain protein  39.52 
 
 
124 aa  75.9  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.014061 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4539  PilT protein domain protein  37.1 
 
 
128 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2455  PilT domain-containing protein  37.5 
 
 
125 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0205  PilT protein domain protein  38.98 
 
 
128 aa  73.6  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.696325  normal  0.132115 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1187  PilT protein domain protein  35.77 
 
 
132 aa  73.6  0.0000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0967234  normal  0.700283 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4043  PilT protein-like  35.2 
 
 
127 aa  72.8  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.280073  normal  0.218169 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4018  hypothetical protein  33.86 
 
 
131 aa  72.4  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2598  PilT domain-containing protein  34.68 
 
 
124 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0709656  normal  0.0156021 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2712  PilT protein domain protein  37.1 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.162006  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0789  PilT domain-containing protein  34.35 
 
 
128 aa  71.6  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1573  PIN domain protein  33.6 
 
 
128 aa  71.6  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1939  PilT protein domain protein  34.96 
 
 
134 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0064  PilT domain-containing protein  34.68 
 
 
128 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.859731  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0277  hypothetical protein  29.92 
 
 
131 aa  68.9  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0011733  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3327  PilT protein domain protein  34.48 
 
 
131 aa  68.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2529  PilT protein domain protein  33.87 
 
 
130 aa  68.2  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2940  PilT domain-containing protein  34.68 
 
 
129 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.085873  normal  0.287636 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0671  PilT domain-containing protein  36.29 
 
 
125 aa  67.8  0.00000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0109  hypothetical protein  33.06 
 
 
128 aa  67.4  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0958283  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2224  PilT protein domain protein  37.6 
 
 
126 aa  67.4  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.292037 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3651  PilT protein domain protein  35.43 
 
 
136 aa  67  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0045  PilT domain-containing protein  33.87 
 
 
128 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.368732  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0025  PilT protein-like  33.87 
 
 
128 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2909  PilT protein domain protein  36.64 
 
 
133 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160929  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4851  PilT domain-containing protein  62.22 
 
 
88 aa  66.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.110114  normal  0.161762 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0660  hypothetical protein  35.48 
 
 
129 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.246636  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00400  hypothetical protein  34.48 
 
 
130 aa  65.5  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0374839 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4037  PilT domain-containing protein  32.82 
 
 
126 aa  64.7  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1720  PilT protein domain protein  34.15 
 
 
129 aa  63.9  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0115  hypothetical protein  56.6 
 
 
62 aa  63.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.178636  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3328  PilT protein domain protein  32.76 
 
 
132 aa  62.8  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0993  PilT protein-like  30.95 
 
 
128 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00952696 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6309  hypothetical protein  33.6 
 
 
125 aa  62  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1292  hypothetical protein  31.25 
 
 
135 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0608  PilT protein domain protein  33.33 
 
 
131 aa  55.5  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.332384  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2346  PilT protein domain protein  32.48 
 
 
128 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4269  PilT protein, N-terminal  33.33 
 
 
136 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.692119  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2422  hypothetical protein  35.16 
 
 
128 aa  54.7  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2734  PilT protein domain protein  33.61 
 
 
128 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180703  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0118  PilT protein-like protein  28.69 
 
 
127 aa  52  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2183  hypothetical protein  43.64 
 
 
71 aa  51.2  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.765275  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2995  PilT protein domain protein  32.79 
 
 
128 aa  51.2  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0565666  normal  0.167497 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2636  PilT protein-like  32.2 
 
 
129 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5379  hypothetical protein  46.3 
 
 
198 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4553  PilT protein-like  30.71 
 
 
142 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0286007  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4312  PilT protein-like  30.71 
 
 
142 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.693301  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3791  PilT domain-containing protein  31.06 
 
 
131 aa  47.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0127598 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4694  PilT domain-containing protein  27.35 
 
 
109 aa  47  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.499917 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4717  PilT domain-containing protein  30.3 
 
 
131 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.603511 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4194  PilT domain-containing protein  30.3 
 
 
131 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.82082  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1056  PilT protein domain protein  26.92 
 
 
130 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0434852 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1068  PilT protein domain protein  30.95 
 
 
133 aa  40.8  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.741251  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>