84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2734 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2734  PilT protein domain protein  100 
 
 		 128 aa  254  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2995  PilT protein domain protein  77.34 
 
 		 128 aa  200  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0565666  normal  0.167497 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1565  PilT domain-containing protein  41.03 
 
 		 128 aa  76.6  0.00000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3687  PilT domain-containing protein  39.83 
 
 		 128 aa  76.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000701912 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1434  PilT protein-like  38.28 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.536835  normal  0.658173 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4034  PilT protein-like  37.61 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.507909 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0205  PilT protein domain protein  36.89 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.696325  normal  0.132115 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00629  PilT protein domain protein  34.75 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000365497  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3315  PilT protein domain protein  37.4 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.424666  normal  0.500122 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31850  PIN domain family protein  39.83 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1408  PilT protein domain protein  27.42 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.748056  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3503  hypothetical protein  39.02 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000000742258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3439  PilT protein domain protein  36.59 
 
 		 133 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0280  hypothetical protein  26.77 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1428  PilT protein domain protein  34.11 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2529  PilT protein domain protein  33.61 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4539  PilT protein domain protein  38.4 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1995  PilT domain-containing protein  37.5 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.691704  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1573  PIN domain protein  36.36 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0109  hypothetical protein  39.32 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0958283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2940  PilT domain-containing protein  32 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.085873  normal  0.287636 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0993  PilT protein-like  36.51 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00952696 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2387  PilT protein domain protein  38.74 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4123  PilT protein domain protein  38.64 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.454937  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1949  PilT protein domain protein  38.64 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3632  PilT protein domain protein  36.97 
 
 		 129 aa  60.1  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0767  PilT protein-like  30 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.351411  normal  0.156815 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0789  PilT domain-containing protein  34.09 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2680  PilT protein domain protein  33.87 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3327  PilT protein domain protein  39.76 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4056  PilT domain-containing protein  36.29 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3715  PilT domain-containing protein  33.86 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0601342 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4379  PilT protein domain protein  36.75 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1038  PilT domain-containing protein  37.61 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.442383 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0706  PilT domain-containing protein  34.35 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.816914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3367  PilT protein domain protein  37.3 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.014061 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0064  PilT domain-containing protein  35.9 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.859731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6344  PilT protein, N-terminal  32.76 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000192359  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0697  hypothetical protein  30.65 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.105307  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3824  PilT protein-like  34.35 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0628  PilT domain-containing protein  34.35 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.478987  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0198  PilT protein domain protein  38.02 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.398764  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1187  PilT protein domain protein  38.98 
 
 		 132 aa  57  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0967234  normal  0.700283 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00400  hypothetical protein  37.5 
 
 		 130 aa  57  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0374839 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1598  PilT protein domain protein  35.25 
 
 		 130 aa  57  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4089  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2442  PilT domain-containing protein  36.44 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0388394  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0465  PilT domain-containing protein  32.48 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0690648  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0025  PilT protein-like  35.04 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0045  PilT domain-containing protein  35.04 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.368732  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2455  PilT domain-containing protein  33.61 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2224  PilT protein domain protein  34.45 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.292037 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2598  PilT domain-containing protein  34.75 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0709656  normal  0.0156021 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4004  PilT protein domain protein  34.19 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000733921  hitchhiker  0.00000000266973 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2648  PilT domain-containing protein  39.36 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0721441 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0576  hypothetical protein  29.06 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0413  PIN domain protein  29.06 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.688316  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2422  hypothetical protein  35.96 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4043  PilT protein-like  33.33 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.280073  normal  0.218169 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6684  PilT protein domain protein  33.61 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.185489  normal  0.593771 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4037  PilT domain-containing protein  38.4 
 
 		 126 aa  51.2  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3737  PilT domain-containing protein  29.41 
 
 		 128 aa  50.8  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0047  PilT protein domain protein  31.85 
 
 		 128 aa  50.4  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0277  hypothetical protein  28.91 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0011733  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4573  PilT protein domain protein  32.23 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.152026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0669  PilT protein domain protein  29.27 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6309  hypothetical protein  31.36 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2346  PilT protein domain protein  37.8 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4956  PilT protein domain protein  31.93 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00799325 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0688  PilT protein domain protein  29.27 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00227105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1572  PilT protein domain protein  32.79 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2712  PilT protein domain protein  36.51 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.162006  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4694  PilT domain-containing protein  36.47 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.499917 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6299  PilT protein-like  37.01 
 
 		 126 aa  47.4  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3678  hypothetical protein  36.05 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.36052  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2968  PilT domain-containing protein  38.14 
 
 		 126 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.691799 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2947  PilT domain-containing protein  38.14 
 
 		 126 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.438865  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2333  PilT protein-like  38.14 
 
 		 126 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0303174  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3328  PilT protein domain protein  31.9 
 
 		 132 aa  43.9  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1056  PilT protein domain protein  26.98 
 
 		 130 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0434852 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0671  PilT domain-containing protein  29.31 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12261  hypothetical protein  44.9 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1939  PilT protein domain protein  27.78 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2909  PilT protein domain protein  34.45 
 
 		 133 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5379  hypothetical protein  40 
 
 		 198 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>