106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2422 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2422  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  258  2e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0789  PilT domain-containing protein  59.38 
 
 		 128 aa  152  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0064  PilT domain-containing protein  57.81 
 
 		 128 aa  147  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.859731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0025  PilT protein-like  57.03 
 
 		 128 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0045  PilT domain-containing protein  57.03 
 
 		 128 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.368732  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0993  PilT protein-like  52.34 
 
 		 128 aa  139  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00952696 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4056  PilT domain-containing protein  55.47 
 
 		 128 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4539  PilT protein domain protein  55.47 
 
 		 128 aa  138  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2346  PilT protein domain protein  57.26 
 
 		 128 aa  135  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0198  PilT protein domain protein  52.89 
 
 		 128 aa  135  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.398764  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2529  PilT protein domain protein  56.2 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0576  hypothetical protein  48.8 
 
 		 125 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1573  PIN domain protein  49.22 
 
 		 128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0413  PIN domain protein  48.8 
 
 		 125 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.688316  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4694  PilT domain-containing protein  53.92 
 
 		 109 aa  116  9e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.499917 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6344  PilT protein, N-terminal  47.66 
 
 		 125 aa  115  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000192359  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3678  hypothetical protein  61.7 
 
 		 94 aa  114  6.9999999999999995e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.36052  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4018  hypothetical protein  44.27 
 
 		 131 aa  112  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4379  PilT protein domain protein  45.31 
 
 		 125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2333  PilT protein-like  46.72 
 
 		 126 aa  103  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0303174  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2947  PilT domain-containing protein  46.72 
 
 		 126 aa  103  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.438865  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2968  PilT domain-containing protein  46.72 
 
 		 126 aa  103  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.691799 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0628  PilT domain-containing protein  43.9 
 
 		 129 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.478987  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3503  hypothetical protein  43.75 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000000742258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1949  PilT protein domain protein  46.97 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0706  PilT domain-containing protein  44.72 
 
 		 129 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.816914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6299  PilT protein-like  46.72 
 
 		 126 aa  100  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0109  hypothetical protein  46.03 
 
 		 128 aa  100  6e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0958283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0697  hypothetical protein  36.43 
 
 		 133 aa  100  7e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.105307  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3824  PilT protein-like  43.9 
 
 		 129 aa  100  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1038  PilT domain-containing protein  42.5 
 
 		 128 aa  98.6  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.442383 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31850  PIN domain family protein  43.9 
 
 		 125 aa  97.4  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2455  PilT domain-containing protein  42.97 
 
 		 125 aa  97.1  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1565  PilT domain-containing protein  42.28 
 
 		 128 aa  97.1  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2680  PilT protein domain protein  43.8 
 
 		 128 aa  93.6  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3715  PilT domain-containing protein  38.1 
 
 		 128 aa  93.2  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0601342 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2648  PilT domain-containing protein  41.46 
 
 		 129 aa  93.2  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0721441 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3367  PilT protein domain protein  47.11 
 
 		 124 aa  92  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.014061 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1408  PilT protein domain protein  39.34 
 
 		 127 aa  91.3  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.748056  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0280  hypothetical protein  35.25 
 
 		 128 aa  90.5  6e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2183  hypothetical protein  64.71 
 
 		 71 aa  89  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.765275  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3632  PilT protein domain protein  41.8 
 
 		 129 aa  89.4  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2442  PilT domain-containing protein  41.22 
 
 		 124 aa  87.8  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0388394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3439  PilT protein domain protein  39.02 
 
 		 133 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3687  PilT domain-containing protein  42.74 
 
 		 128 aa  85.9  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000701912 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2598  PilT domain-containing protein  42.64 
 
 		 124 aa  85.9  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0709656  normal  0.0156021 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2940  PilT domain-containing protein  40.68 
 
 		 129 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.085873  normal  0.287636 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00629  PilT protein domain protein  38.33 
 
 		 128 aa  85.1  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000365497  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2712  PilT protein domain protein  42.98 
 
 		 124 aa  84.7  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.162006  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4123  PilT protein domain protein  43.44 
 
 		 126 aa  84.3  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.454937  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3315  PilT protein domain protein  37.4 
 
 		 133 aa  84.3  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.424666  normal  0.500122 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0277  hypothetical protein  35.25 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0011733  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00400  hypothetical protein  41.18 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0374839 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1598  PilT protein domain protein  37.21 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4089  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0767  PilT protein-like  36.89 
 
 		 128 aa  81.6  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.351411  normal  0.156815 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1187  PilT protein domain protein  40.34 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0967234  normal  0.700283 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1428  PilT protein domain protein  37.4 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0205  PilT protein domain protein  37.7 
 
 		 128 aa  79.7  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.696325  normal  0.132115 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4043  PilT protein-like  36.51 
 
 		 127 aa  79  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.280073  normal  0.218169 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2387  PilT protein domain protein  36.36 
 
 		 127 aa  79  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4034  PilT protein-like  34.15 
 
 		 128 aa  78.6  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.507909 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0465  PilT domain-containing protein  34.45 
 
 		 125 aa  77.8  0.00000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0690648  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3737  PilT domain-containing protein  32.5 
 
 		 128 aa  77.8  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1572  PilT protein domain protein  39.67 
 
 		 125 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4037  PilT domain-containing protein  36.07 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0047  PilT protein domain protein  37.1 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0669  PilT protein domain protein  36.15 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0688  PilT protein domain protein  36.15 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00227105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4004  PilT protein domain protein  35.71 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000733921  hitchhiker  0.00000000266973 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2224  PilT protein domain protein  39.67 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.292037 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1995  PilT domain-containing protein  37.9 
 
 		 128 aa  73.6  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.691704  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3327  PilT protein domain protein  37.93 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1434  PilT protein-like  33.07 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.536835  normal  0.658173 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6684  PilT protein domain protein  35.16 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.185489  normal  0.593771 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0671  PilT domain-containing protein  30.58 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4956  PilT protein domain protein  35.11 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00799325 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6309  hypothetical protein  33.33 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2995  PilT protein domain protein  32.56 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0565666  normal  0.167497 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3651  PilT protein domain protein  34.48 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4573  PilT protein domain protein  32.8 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.152026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2734  PilT protein domain protein  32.56 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4194  PilT domain-containing protein  33.87 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.82082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3791  PilT domain-containing protein  33.87 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0127598 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2220  PilT protein domain protein  32.2 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2268  PilT protein-like  36.15 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.375245  normal  0.653218 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4269  PilT protein, N-terminal  31.71 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.692119  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2182  hypothetical protein  58.54 
 
 		 42 aa  54.7  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.931178  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3328  PilT protein domain protein  29.51 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4717  PilT domain-containing protein  33.06 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.603511 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2032  PilT domain-containing protein  33.62 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1056  PilT protein domain protein  29.03 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0434852 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4312  PilT protein-like  30.95 
 
 		 142 aa  52  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.693301  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4553  PilT protein-like  30.95 
 
 		 142 aa  52  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0286007  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5379  hypothetical protein  39.29 
 
 		 198 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0115  hypothetical protein  54.17 
 
 		 62 aa  52  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.178636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2909  PilT protein domain protein  33.88 
 
 		 133 aa  51.2  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160929  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0118  PilT protein-like protein  27.69 
 
 		 127 aa  50.4  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2398  PilT domain-containing protein  36.67 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1720  PilT protein domain protein  28.33 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0660  hypothetical protein  27.05 
 
 		 129 aa  47.8  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.246636  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>