107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1408 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1408  PilT protein domain protein  100 
 
 		 127 aa  251  2.0000000000000002e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.748056  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3687  PilT domain-containing protein  43.75 
 
 		 128 aa  120  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000701912 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0767  PilT protein-like  42.97 
 
 		 128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.351411  normal  0.156815 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0280  hypothetical protein  42.52 
 
 		 128 aa  110  6e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1995  PilT domain-containing protein  40.62 
 
 		 128 aa  110  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.691704  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0047  PilT protein domain protein  41.41 
 
 		 128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2680  PilT protein domain protein  38.58 
 
 		 128 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3715  PilT domain-containing protein  39.69 
 
 		 128 aa  100  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0601342 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1428  PilT protein domain protein  37.5 
 
 		 132 aa  100  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4034  PilT protein-like  35.16 
 
 		 128 aa  100  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.507909 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1038  PilT domain-containing protein  42.52 
 
 		 128 aa  96.7  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.442383 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4123  PilT protein domain protein  35.77 
 
 		 126 aa  96.3  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.454937  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1565  PilT domain-containing protein  35.16 
 
 		 128 aa  95.9  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0465  PilT domain-containing protein  37.9 
 
 		 125 aa  95.1  3e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0690648  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0669  PilT protein domain protein  39.06 
 
 		 128 aa  94.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4379  PilT protein domain protein  39.34 
 
 		 125 aa  93.6  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2387  PilT protein domain protein  35.71 
 
 		 127 aa  93.6  8e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0688  PilT protein domain protein  39.06 
 
 		 128 aa  93.6  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00227105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4043  PilT protein-like  34.68 
 
 		 127 aa  92.8  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.280073  normal  0.218169 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4004  PilT protein domain protein  36.29 
 
 		 127 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000733921  hitchhiker  0.00000000266973 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0697  hypothetical protein  37.7 
 
 		 133 aa  90.9  5e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.105307  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0789  PilT domain-containing protein  35.54 
 
 		 128 aa  90.9  5e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6344  PilT protein, N-terminal  42.24 
 
 		 125 aa  90.5  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000192359  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3503  hypothetical protein  36.07 
 
 		 124 aa  90.5  7e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000000742258  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31850  PIN domain family protein  36.89 
 
 		 125 aa  89.7  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3439  PilT protein domain protein  35.2 
 
 		 133 aa  89  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3315  PilT protein domain protein  35.2 
 
 		 133 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.424666  normal  0.500122 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2712  PilT protein domain protein  38.21 
 
 		 124 aa  88.2  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.162006  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4539  PilT protein domain protein  36.36 
 
 		 128 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00629  PilT protein domain protein  35.77 
 
 		 128 aa  87.8  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000365497  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3737  PilT domain-containing protein  35.77 
 
 		 128 aa  87.4  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1434  PilT protein-like  36.8 
 
 		 125 aa  86.7  9e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.536835  normal  0.658173 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0205  PilT protein domain protein  36.72 
 
 		 128 aa  86.7  9e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.696325  normal  0.132115 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6299  PilT protein-like  35.2 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0109  hypothetical protein  35.16 
 
 		 128 aa  85.1  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0958283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4037  PilT domain-containing protein  33.86 
 
 		 126 aa  84.7  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4056  PilT domain-containing protein  35.54 
 
 		 128 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2333  PilT protein-like  34.4 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0303174  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2947  PilT domain-containing protein  34.4 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.438865  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2968  PilT domain-containing protein  34.4 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.691799 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1573  PIN domain protein  33.86 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3632  PilT protein domain protein  37.61 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4018  hypothetical protein  30.47 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4956  PilT protein domain protein  35.2 
 
 		 132 aa  82.4  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00799325 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2455  PilT domain-containing protein  36.89 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6684  PilT protein domain protein  37.21 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.185489  normal  0.593771 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0277  hypothetical protein  37.93 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0011733  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0198  PilT protein domain protein  34.96 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.398764  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3367  PilT protein domain protein  34.11 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.014061 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0576  hypothetical protein  32.77 
 
 		 125 aa  80.1  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0413  PIN domain protein  32.77 
 
 		 125 aa  80.1  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.688316  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2598  PilT domain-containing protein  31.45 
 
 		 124 aa  80.1  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0709656  normal  0.0156021 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2940  PilT domain-containing protein  32.5 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.085873  normal  0.287636 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2442  PilT domain-containing protein  33.06 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0388394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2422  hypothetical protein  37.84 
 
 		 128 aa  78.6  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0993  PilT protein-like  36.51 
 
 		 128 aa  78.6  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00952696 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4573  PilT protein domain protein  33.07 
 
 		 136 aa  77.8  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.152026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0064  PilT domain-containing protein  30.58 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.859731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2529  PilT protein domain protein  34.71 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0025  PilT protein-like  29.75 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0045  PilT domain-containing protein  29.75 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.368732  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4694  PilT domain-containing protein  38.24 
 
 		 109 aa  73.9  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.499917 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0671  PilT domain-containing protein  33.86 
 
 		 125 aa  73.2  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0118  PilT protein-like protein  29.84 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1949  PilT protein domain protein  29.84 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2224  PilT protein domain protein  33.6 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.292037 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6309  hypothetical protein  33.07 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2734  PilT protein domain protein  27.42 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1572  PilT protein domain protein  30.89 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1187  PilT protein domain protein  26.98 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0967234  normal  0.700283 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3328  PilT protein domain protein  27.35 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2995  PilT protein domain protein  23.81 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0565666  normal  0.167497 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1598  PilT protein domain protein  28.35 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4089  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0706  PilT domain-containing protein  33.05 
 
 		 129 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.816914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2346  PilT protein domain protein  32.73 
 
 		 128 aa  62  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3824  PilT protein-like  30.58 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0628  PilT domain-containing protein  32.2 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.478987  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3678  hypothetical protein  33.68 
 
 		 94 aa  60.8  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.36052  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3791  PilT domain-containing protein  30.77 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0127598 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2909  PilT protein domain protein  31.39 
 
 		 133 aa  60.1  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4194  PilT domain-containing protein  29.23 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.82082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4717  PilT domain-containing protein  29.23 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.603511 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1939  PilT protein domain protein  29.17 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00400  hypothetical protein  26.96 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0374839 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2648  PilT domain-containing protein  29.75 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0721441 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0115  hypothetical protein  50 
 
 		 62 aa  56.6  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.178636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3651  PilT protein domain protein  28.35 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0660  hypothetical protein  29.75 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.246636  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1068  PilT protein domain protein  28.23 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.741251  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3327  PilT protein domain protein  26.09 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5379  hypothetical protein  38.46 
 
 		 198 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1056  PilT protein domain protein  25.38 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0434852 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2220  PilT protein domain protein  29.66 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4312  PilT protein-like  25 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.693301  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4553  PilT protein-like  25 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0286007  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1720  PilT protein domain protein  30.08 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2268  PilT protein-like  28.68 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.375245  normal  0.653218 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4269  PilT protein, N-terminal  27.69 
 
 		 136 aa  47.4  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.692119  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2183  hypothetical protein  40.32 
 
 		 71 aa  47.8  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.765275  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2398  PilT domain-containing protein  28.1 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>