106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A3824 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A3824  PilT protein-like  100 
 
 
129 aa  260  4.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0628  PilT domain-containing protein  96.12 
 
 
129 aa  254  4e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.478987  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0706  PilT domain-containing protein  96.9 
 
 
129 aa  254  4e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.816914  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2648  PilT domain-containing protein  96.12 
 
 
129 aa  249  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0721441 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1573  PIN domain protein  48.44 
 
 
128 aa  105  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0576  hypothetical protein  45.6 
 
 
125 aa  105  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0413  PIN domain protein  45.6 
 
 
125 aa  105  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.688316  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6344  PilT protein, N-terminal  44.53 
 
 
125 aa  103  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000192359  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0064  PilT domain-containing protein  47.97 
 
 
128 aa  100  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.859731  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3315  PilT protein domain protein  42.06 
 
 
133 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.424666  normal  0.500122 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0198  PilT protein domain protein  44.96 
 
 
128 aa  99.8  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.398764  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0993  PilT protein-like  44.09 
 
 
128 aa  99.4  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00952696 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0025  PilT protein-like  47.15 
 
 
128 aa  98.2  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0045  PilT domain-containing protein  47.15 
 
 
128 aa  98.2  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.368732  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3439  PilT protein domain protein  43.65 
 
 
133 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4379  PilT protein domain protein  45.45 
 
 
125 aa  96.7  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0789  PilT domain-containing protein  47.15 
 
 
128 aa  95.1  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00629  PilT protein domain protein  42.11 
 
 
128 aa  93.2  9e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000365497  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2455  PilT domain-containing protein  43.1 
 
 
125 aa  92  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4956  PilT protein domain protein  41.6 
 
 
132 aa  92.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00799325 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4018  hypothetical protein  40.46 
 
 
131 aa  92  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4539  PilT protein domain protein  43.55 
 
 
128 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6684  PilT protein domain protein  37.9 
 
 
132 aa  92  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.185489  normal  0.593771 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0047  PilT protein domain protein  48.82 
 
 
128 aa  91.3  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2333  PilT protein-like  42.52 
 
 
126 aa  90.9  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0303174  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2947  PilT domain-containing protein  42.52 
 
 
126 aa  90.9  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.438865  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2968  PilT domain-containing protein  42.52 
 
 
126 aa  90.9  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.691799 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4034  PilT protein-like  43.7 
 
 
128 aa  89.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.507909 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2346  PilT protein domain protein  47.83 
 
 
128 aa  89  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2442  PilT domain-containing protein  42.06 
 
 
124 aa  88.2  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0388394  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0109  hypothetical protein  42.98 
 
 
128 aa  88.6  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0958283  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1038  PilT domain-containing protein  45 
 
 
128 aa  88.2  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.442383 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4056  PilT domain-containing protein  42.74 
 
 
128 aa  87.4  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2529  PilT protein domain protein  43.9 
 
 
130 aa  87.8  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6299  PilT protein-like  42.52 
 
 
126 aa  87.4  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4004  PilT protein domain protein  38.76 
 
 
127 aa  87.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000733921  hitchhiker  0.00000000266973 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4043  PilT protein-like  37.98 
 
 
127 aa  87  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.280073  normal  0.218169 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1995  PilT domain-containing protein  47.46 
 
 
128 aa  87  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.691704  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31850  PIN domain family protein  40.5 
 
 
125 aa  86.3  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0767  PilT protein-like  39.83 
 
 
128 aa  85.5  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.351411  normal  0.156815 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3367  PilT protein domain protein  42.86 
 
 
124 aa  85.9  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.014061 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3687  PilT domain-containing protein  47.46 
 
 
128 aa  85.1  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000701912 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2422  hypothetical protein  40.87 
 
 
128 aa  83.2  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3503  hypothetical protein  42.15 
 
 
124 aa  82.8  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000000742258  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3737  PilT domain-containing protein  39.2 
 
 
128 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1428  PilT protein domain protein  40.31 
 
 
132 aa  82  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3715  PilT domain-containing protein  40.68 
 
 
128 aa  82  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0601342 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1572  PilT protein domain protein  37.8 
 
 
125 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2680  PilT protein domain protein  37.61 
 
 
128 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0280  hypothetical protein  33.59 
 
 
128 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0697  hypothetical protein  32.26 
 
 
133 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.105307  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4694  PilT domain-containing protein  45.19 
 
 
109 aa  79  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.499917 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2598  PilT domain-containing protein  40.16 
 
 
124 aa  79  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0709656  normal  0.0156021 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1434  PilT protein-like  39.52 
 
 
125 aa  78.2  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.536835  normal  0.658173 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4037  PilT domain-containing protein  39.34 
 
 
126 aa  78.6  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3632  PilT protein domain protein  43.22 
 
 
129 aa  78.6  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1949  PilT protein domain protein  41.6 
 
 
128 aa  78.6  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0277  hypothetical protein  33.06 
 
 
131 aa  78.2  0.00000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0011733  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0671  PilT domain-containing protein  36.67 
 
 
125 aa  77.8  0.00000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1565  PilT domain-containing protein  43.22 
 
 
128 aa  77  0.00000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0465  PilT domain-containing protein  37.1 
 
 
125 aa  76.6  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0690648  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0205  PilT protein domain protein  40.34 
 
 
128 aa  75.9  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.696325  normal  0.132115 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2940  PilT domain-containing protein  40.65 
 
 
129 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.085873  normal  0.287636 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1598  PilT protein domain protein  44.07 
 
 
130 aa  74.7  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4089  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4123  PilT protein domain protein  41.32 
 
 
126 aa  74.7  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.454937  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6309  hypothetical protein  38.79 
 
 
125 aa  74.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0669  PilT protein domain protein  34.68 
 
 
128 aa  73.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0688  PilT protein domain protein  34.68 
 
 
128 aa  73.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00227105  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2387  PilT protein domain protein  37.19 
 
 
127 aa  72.4  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2712  PilT protein domain protein  39.67 
 
 
124 aa  71.2  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.162006  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2224  PilT protein domain protein  42.98 
 
 
126 aa  69.7  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.292037 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4573  PilT protein domain protein  31.36 
 
 
136 aa  68.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.152026  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3678  hypothetical protein  46.43 
 
 
94 aa  67.4  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.36052  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2909  PilT protein domain protein  41.53 
 
 
133 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160929  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3327  PilT protein domain protein  34.48 
 
 
131 aa  63.2  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3328  PilT protein domain protein  35.65 
 
 
132 aa  62.4  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3791  PilT domain-containing protein  37.1 
 
 
131 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0127598 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2995  PilT protein domain protein  40.34 
 
 
128 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0565666  normal  0.167497 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1408  PilT protein domain protein  30.58 
 
 
127 aa  61.2  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.748056  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00400  hypothetical protein  39.32 
 
 
130 aa  60.5  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0374839 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3651  PilT protein domain protein  31.85 
 
 
136 aa  60.5  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5379  hypothetical protein  51.72 
 
 
198 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4269  PilT protein, N-terminal  35.43 
 
 
136 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.692119  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0118  PilT protein-like protein  28.89 
 
 
127 aa  58.9  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1187  PilT protein domain protein  33.86 
 
 
132 aa  58.9  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0967234  normal  0.700283 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4717  PilT domain-containing protein  36.29 
 
 
131 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.603511 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4194  PilT domain-containing protein  36.29 
 
 
131 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.82082  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2734  PilT protein domain protein  34.35 
 
 
128 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180703  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0115  hypothetical protein  54.72 
 
 
62 aa  57  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.178636  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4312  PilT protein-like  32.58 
 
 
142 aa  53.5  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.693301  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4553  PilT protein-like  32.58 
 
 
142 aa  53.5  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0286007  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2183  hypothetical protein  50 
 
 
71 aa  51.6  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.765275  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2636  PilT protein-like  37.19 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2268  PilT protein-like  31.5 
 
 
136 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.375245  normal  0.653218 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1068  PilT protein domain protein  32.28 
 
 
133 aa  47.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.741251  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0660  hypothetical protein  31.97 
 
 
129 aa  46.6  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.246636  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1939  PilT protein domain protein  29.27 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4851  PilT domain-containing protein  42.86 
 
 
88 aa  45.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.110114  normal  0.161762 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0608  PilT protein domain protein  30.51 
 
 
131 aa  44.7  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.332384  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2032  PilT domain-containing protein  31.97 
 
 
136 aa  43.9  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>