101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2940 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2940  PilT domain-containing protein  100 
 
 
129 aa  249  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.085873  normal  0.287636 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3327  PilT protein domain protein  55.12 
 
 
131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1187  PilT protein domain protein  47.2 
 
 
132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0967234  normal  0.700283 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1598  PilT protein domain protein  47.29 
 
 
130 aa  111  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4089  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00400  hypothetical protein  47.41 
 
 
130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0374839 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2680  PilT protein domain protein  40.5 
 
 
128 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3632  PilT protein domain protein  36.97 
 
 
129 aa  92.8  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0205  PilT protein domain protein  42.98 
 
 
128 aa  90.9  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.696325  normal  0.132115 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0789  PilT domain-containing protein  40.68 
 
 
128 aa  87.4  6e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3439  PilT protein domain protein  44.92 
 
 
133 aa  84.3  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3328  PilT protein domain protein  37.72 
 
 
132 aa  83.6  8e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2442  PilT domain-containing protein  40.34 
 
 
124 aa  82.8  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0388394  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2598  PilT domain-containing protein  41.18 
 
 
124 aa  82.8  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0709656  normal  0.0156021 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00629  PilT protein domain protein  35.83 
 
 
128 aa  83.2  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000365497  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0465  PilT domain-containing protein  39.13 
 
 
125 aa  82.4  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0690648  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0109  hypothetical protein  38.66 
 
 
128 aa  82  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0958283  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3715  PilT domain-containing protein  39.5 
 
 
128 aa  82  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0601342 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3315  PilT protein domain protein  43.8 
 
 
133 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.424666  normal  0.500122 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0047  PilT protein domain protein  40.65 
 
 
128 aa  82  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2712  PilT protein domain protein  40.83 
 
 
124 aa  81.6  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.162006  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3367  PilT protein domain protein  41.73 
 
 
124 aa  81.3  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.014061 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4043  PilT protein-like  35.25 
 
 
127 aa  79  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.280073  normal  0.218169 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1038  PilT domain-containing protein  43.1 
 
 
128 aa  79  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.442383 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4379  PilT protein domain protein  37.29 
 
 
125 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1408  PilT protein domain protein  32.5 
 
 
127 aa  79.3  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.748056  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3503  hypothetical protein  39.13 
 
 
124 aa  78.6  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000000742258  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0280  hypothetical protein  33.62 
 
 
128 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0064  PilT domain-containing protein  36.44 
 
 
128 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.859731  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0669  PilT protein domain protein  37.7 
 
 
128 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1949  PilT protein domain protein  39.5 
 
 
128 aa  78.2  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1565  PilT domain-containing protein  35.29 
 
 
128 aa  78.2  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1573  PIN domain protein  41.53 
 
 
128 aa  77.8  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4004  PilT protein domain protein  35.25 
 
 
127 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000733921  hitchhiker  0.00000000266973 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0576  hypothetical protein  37.39 
 
 
125 aa  77.4  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0413  PIN domain protein  37.39 
 
 
125 aa  77.4  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.688316  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0688  PilT protein domain protein  37.7 
 
 
128 aa  77.4  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00227105  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0628  PilT domain-containing protein  40.65 
 
 
129 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.478987  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4037  PilT domain-containing protein  39.37 
 
 
126 aa  76.6  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0706  PilT domain-containing protein  40.65 
 
 
129 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.816914  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0767  PilT protein-like  32.79 
 
 
128 aa  75.9  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.351411  normal  0.156815 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0025  PilT protein-like  35.59 
 
 
128 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0045  PilT domain-containing protein  35.59 
 
 
128 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.368732  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4539  PilT protein domain protein  38.79 
 
 
128 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0198  PilT protein domain protein  38.14 
 
 
128 aa  76.3  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.398764  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4034  PilT protein-like  33.62 
 
 
128 aa  75.1  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.507909 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3824  PilT protein-like  40.65 
 
 
129 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2387  PilT protein domain protein  37.29 
 
 
127 aa  75.1  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2346  PilT protein domain protein  40.37 
 
 
128 aa  75.1  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0697  hypothetical protein  32.23 
 
 
133 aa  73.6  0.0000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.105307  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2529  PilT protein domain protein  35.83 
 
 
130 aa  73.2  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1428  PilT protein domain protein  31.62 
 
 
132 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0671  PilT domain-containing protein  33.9 
 
 
125 aa  71.2  0.000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4056  PilT domain-containing protein  38.33 
 
 
128 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4123  PilT protein domain protein  37.4 
 
 
126 aa  70.5  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.454937  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1434  PilT protein-like  33.33 
 
 
125 aa  69.7  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.536835  normal  0.658173 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0993  PilT protein-like  32.2 
 
 
128 aa  69.3  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00952696 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3687  PilT domain-containing protein  36.13 
 
 
128 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000701912 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2648  PilT domain-containing protein  38.33 
 
 
129 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0721441 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0277  hypothetical protein  29.27 
 
 
131 aa  67.8  0.00000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0011733  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6344  PilT protein, N-terminal  33.33 
 
 
125 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000192359  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2422  hypothetical protein  40.68 
 
 
128 aa  68.2  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6684  PilT protein domain protein  34.68 
 
 
132 aa  67.8  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.185489  normal  0.593771 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4956  PilT protein domain protein  34.68 
 
 
132 aa  67  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00799325 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31850  PIN domain family protein  35.83 
 
 
125 aa  66.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1995  PilT domain-containing protein  32.23 
 
 
128 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.691704  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2333  PilT protein-like  33.05 
 
 
126 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0303174  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2947  PilT domain-containing protein  33.05 
 
 
126 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.438865  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2968  PilT domain-containing protein  33.05 
 
 
126 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.691799 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6299  PilT protein-like  34.71 
 
 
126 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3737  PilT domain-containing protein  31.9 
 
 
128 aa  63.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4018  hypothetical protein  34.71 
 
 
131 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2995  PilT protein domain protein  35.2 
 
 
128 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0565666  normal  0.167497 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4269  PilT protein, N-terminal  37.5 
 
 
136 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.692119  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4694  PilT domain-containing protein  37.63 
 
 
109 aa  62.4  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.499917 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2455  PilT domain-containing protein  32.77 
 
 
125 aa  61.6  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2734  PilT protein domain protein  32 
 
 
128 aa  61.6  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180703  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0118  PilT protein-like protein  31.67 
 
 
127 aa  60.8  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1572  PilT protein domain protein  35.34 
 
 
125 aa  60.1  0.000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2032  PilT domain-containing protein  32.5 
 
 
136 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1056  PilT protein domain protein  34.45 
 
 
130 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0434852 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2183  hypothetical protein  47.27 
 
 
71 aa  55.5  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.765275  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6309  hypothetical protein  34.29 
 
 
125 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2909  PilT protein domain protein  28.45 
 
 
133 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160929  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3791  PilT domain-containing protein  35.66 
 
 
131 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0127598 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1292  hypothetical protein  32.2 
 
 
135 aa  52.4  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4194  PilT domain-containing protein  35.66 
 
 
131 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.82082  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4717  PilT domain-containing protein  35.66 
 
 
131 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.603511 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4312  PilT protein-like  32.23 
 
 
142 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.693301  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4553  PilT protein-like  32.23 
 
 
142 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0286007  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4573  PilT protein domain protein  27.73 
 
 
136 aa  50.8  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.152026  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2268  PilT protein-like  32.8 
 
 
136 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.375245  normal  0.653218 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2224  PilT protein domain protein  31.36 
 
 
126 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.292037 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5379  hypothetical protein  40.74 
 
 
198 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0115  hypothetical protein  42.11 
 
 
62 aa  49.3  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.178636  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1939  PilT protein domain protein  26.96 
 
 
134 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3651  PilT protein domain protein  26.05 
 
 
136 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0660  hypothetical protein  34.75 
 
 
129 aa  47.8  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.246636  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3678  hypothetical protein  32.97 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.36052  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1720  PilT protein domain protein  31.36 
 
 
129 aa  43.5  0.0009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1068  PilT protein domain protein  30.25 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.741251  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>