99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_00400 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_00400  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  254  4e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0374839 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1187  PilT protein domain protein  60.8 
 
 		 132 aa  149  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0967234  normal  0.700283 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1598  PilT protein domain protein  52.89 
 
 		 130 aa  117  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4089  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2940  PilT domain-containing protein  47.41 
 
 		 129 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.085873  normal  0.287636 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3632  PilT protein domain protein  44.8 
 
 		 129 aa  108  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3327  PilT protein domain protein  46.22 
 
 		 131 aa  108  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3715  PilT domain-containing protein  44 
 
 		 128 aa  93.2  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0601342 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3328  PilT protein domain protein  42.02 
 
 		 132 aa  92.8  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0205  PilT protein domain protein  46.9 
 
 		 128 aa  90.9  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.696325  normal  0.132115 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0789  PilT domain-containing protein  45.54 
 
 		 128 aa  90.5  8e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0109  hypothetical protein  43.97 
 
 		 128 aa  89.7  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0958283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3315  PilT protein domain protein  49.14 
 
 		 133 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.424666  normal  0.500122 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6309  hypothetical protein  43.9 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2387  PilT protein domain protein  43.22 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0198  PilT protein domain protein  40.87 
 
 		 128 aa  81.6  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.398764  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4056  PilT domain-containing protein  39.13 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1572  PilT protein domain protein  41.13 
 
 		 125 aa  78.6  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2712  PilT protein domain protein  42.98 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.162006  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4539  PilT protein domain protein  40 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1573  PIN domain protein  43.22 
 
 		 128 aa  78.6  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1428  PilT protein domain protein  34.65 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3439  PilT protein domain protein  46.49 
 
 		 133 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1565  PilT domain-containing protein  39.5 
 
 		 128 aa  78.6  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0576  hypothetical protein  37.29 
 
 		 125 aa  77.8  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0413  PIN domain protein  37.29 
 
 		 125 aa  77.8  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.688316  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2598  PilT domain-containing protein  40.98 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0709656  normal  0.0156021 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3367  PilT protein domain protein  42.62 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.014061 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00629  PilT protein domain protein  34.48 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000365497  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0993  PilT protein-like  37.5 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00952696 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2442  PilT domain-containing protein  38.52 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0388394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31850  PIN domain family protein  37.6 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4123  PilT protein domain protein  42.86 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.454937  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1949  PilT protein domain protein  44.25 
 
 		 128 aa  72  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2422  hypothetical protein  38.74 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4379  PilT protein domain protein  37.5 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2455  PilT domain-containing protein  35.2 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3503  hypothetical protein  36 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000000742258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3737  PilT domain-containing protein  37.07 
 
 		 128 aa  70.1  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1038  PilT domain-containing protein  38.52 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.442383 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2680  PilT protein domain protein  35.71 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4004  PilT protein domain protein  33.87 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000733921  hitchhiker  0.00000000266973 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3687  PilT domain-containing protein  37.07 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000701912 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0064  PilT domain-containing protein  36.52 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.859731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4018  hypothetical protein  36.59 
 
 		 131 aa  67  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4043  PilT protein-like  32.26 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.280073  normal  0.218169 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0280  hypothetical protein  27.5 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1434  PilT protein-like  35.88 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.536835  normal  0.658173 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6684  PilT protein domain protein  34.48 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.185489  normal  0.593771 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0767  PilT protein-like  30.25 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.351411  normal  0.156815 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6344  PilT protein, N-terminal  36.61 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000192359  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0697  hypothetical protein  28.23 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.105307  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0025  PilT protein-like  35.65 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0045  PilT domain-containing protein  35.65 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.368732  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0669  PilT protein domain protein  34.21 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6299  PilT protein-like  39.13 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4034  PilT protein-like  31.58 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.507909 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0688  PilT protein domain protein  34.21 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00227105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2333  PilT protein-like  39.29 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0303174  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0047  PilT protein domain protein  35.88 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4037  PilT domain-containing protein  36.13 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2909  PilT protein domain protein  33.86 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2947  PilT domain-containing protein  39.29 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.438865  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2968  PilT domain-containing protein  39.29 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.691799 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0706  PilT domain-containing protein  39.32 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.816914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2529  PilT protein domain protein  33.91 
 
 		 130 aa  62  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2346  PilT protein domain protein  33.9 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2224  PilT protein domain protein  41.96 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.292037 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1995  PilT domain-containing protein  31.36 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.691704  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3824  PilT protein-like  39.32 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0628  PilT domain-containing protein  38.46 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.478987  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4694  PilT domain-containing protein  39.36 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.499917 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4956  PilT protein domain protein  32.17 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00799325 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0465  PilT domain-containing protein  31.71 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0690648  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0671  PilT domain-containing protein  33.62 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1408  PilT protein domain protein  26.96 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.748056  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4573  PilT protein domain protein  32.76 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.152026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2648  PilT domain-containing protein  39.47 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0721441 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3651  PilT protein domain protein  26.77 
 
 		 136 aa  57  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2734  PilT protein domain protein  37.5 
 
 		 128 aa  57  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180703  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0277  hypothetical protein  24 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0011733  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2032  PilT domain-containing protein  32.26 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2995  PilT protein domain protein  34.4 
 
 		 128 aa  52.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0565666  normal  0.167497 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1056  PilT protein domain protein  32.2 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0434852 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3791  PilT domain-containing protein  34.35 
 
 		 131 aa  51.2  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0127598 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4269  PilT protein, N-terminal  32.03 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.692119  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4717  PilT domain-containing protein  33.59 
 
 		 131 aa  48.1  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.603511 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1939  PilT protein domain protein  26.61 
 
 		 134 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4194  PilT domain-containing protein  33.59 
 
 		 131 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.82082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3678  hypothetical protein  41.38 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.36052  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2183  hypothetical protein  38.89 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.765275  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0118  PilT protein-like protein  25.86 
 
 		 127 aa  43.9  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1720  PilT protein domain protein  26.89 
 
 		 129 aa  43.9  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1068  PilT protein domain protein  30.7 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.741251  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12844  hypothetical protein  30.4 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000370352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0660  hypothetical protein  28.95 
 
 		 129 aa  41.6  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.246636  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0608  PilT protein domain protein  29.66 
 
 		 131 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.332384  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4553  PilT protein-like  32.5 
 
 		 142 aa  40.8  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0286007  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4312  PilT protein-like  32.5 
 
 		 142 aa  40.8  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.693301  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0115  hypothetical protein  33.33 
 
 		 62 aa  40.8  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.178636  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>