72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2183 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2183  hypothetical protein  100 
 
 		 71 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.765275  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0789  PilT domain-containing protein  54.93 
 
 		 128 aa  81.6  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0064  PilT domain-containing protein  54.41 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.859731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0045  PilT domain-containing protein  54.41 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.368732  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0025  PilT protein-like  54.41 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2529  PilT protein domain protein  55.88 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2422  hypothetical protein  61.97 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0198  PilT protein domain protein  51.56 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.398764  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2346  PilT protein domain protein  58.33 
 
 		 128 aa  67  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1573  PIN domain protein  48.28 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4056  PilT domain-containing protein  44.12 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0697  hypothetical protein  52.83 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.105307  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4539  PilT protein domain protein  49.15 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0993  PilT protein-like  41.18 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00952696 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0109  hypothetical protein  47.06 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0958283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3327  PilT protein domain protein  52.83 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2940  PilT domain-containing protein  47.27 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.085873  normal  0.287636 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0413  PIN domain protein  41.82 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.688316  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0576  hypothetical protein  41.82 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0628  PilT domain-containing protein  50 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.478987  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1428  PilT protein domain protein  45.28 
 
 		 132 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0706  PilT domain-containing protein  50 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.816914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3824  PilT protein-like  50 
 
 		 129 aa  51.6  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0277  hypothetical protein  45.28 
 
 		 131 aa  51.2  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0011733  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6684  PilT protein domain protein  43.64 
 
 		 132 aa  51.2  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.185489  normal  0.593771 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1598  PilT protein domain protein  46.15 
 
 		 130 aa  50.8  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4089  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2680  PilT protein domain protein  38.81 
 
 		 128 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4694  PilT domain-containing protein  53.33 
 
 		 109 aa  50.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.499917 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1038  PilT domain-containing protein  48.08 
 
 		 128 aa  50.4  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.442383 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6344  PilT protein, N-terminal  40.68 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000192359  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4379  PilT protein domain protein  42.37 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3367  PilT protein domain protein  45.28 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.014061 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2968  PilT domain-containing protein  40.68 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.691799 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2333  PilT protein-like  40.68 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0303174  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2947  PilT domain-containing protein  40.68 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.438865  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2648  PilT domain-containing protein  48.08 
 
 		 129 aa  47.8  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0721441 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4018  hypothetical protein  37.7 
 
 		 131 aa  47.8  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1408  PilT protein domain protein  40.32 
 
 		 127 aa  47.8  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.748056  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2712  PilT protein domain protein  43.4 
 
 		 124 aa  47.4  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.162006  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00629  PilT protein domain protein  41.18 
 
 		 128 aa  47.4  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000365497  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4956  PilT protein domain protein  43.64 
 
 		 132 aa  47  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00799325 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5379  hypothetical protein  49.06 
 
 		 198 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31850  PIN domain family protein  41.67 
 
 		 125 aa  47  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00400  hypothetical protein  38.89 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0374839 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3439  PilT protein domain protein  38.98 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0280  hypothetical protein  38.6 
 
 		 128 aa  46.2  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3315  PilT protein domain protein  37.29 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.424666  normal  0.500122 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4004  PilT protein domain protein  41.51 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000733921  hitchhiker  0.00000000266973 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4043  PilT protein-like  37.74 
 
 		 127 aa  45.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.280073  normal  0.218169 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1949  PilT protein domain protein  42.37 
 
 		 128 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0767  PilT protein-like  39.66 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.351411  normal  0.156815 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1995  PilT domain-containing protein  39.62 
 
 		 128 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.691704  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3651  PilT protein domain protein  41.07 
 
 		 136 aa  45.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3328  PilT protein domain protein  38.46 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1187  PilT protein domain protein  34.92 
 
 		 132 aa  45.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0967234  normal  0.700283 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3503  hypothetical protein  39.62 
 
 		 124 aa  45.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000000742258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3687  PilT domain-containing protein  41.51 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000701912 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3632  PilT protein domain protein  39.62 
 
 		 129 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2387  PilT protein domain protein  35.59 
 
 		 127 aa  45.1  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3678  hypothetical protein  64.71 
 
 		 94 aa  44.3  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.36052  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0047  PilT protein domain protein  39.62 
 
 		 128 aa  43.9  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3715  PilT domain-containing protein  43.4 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0601342 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6299  PilT protein-like  40 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1572  PilT protein domain protein  41.27 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2220  PilT protein domain protein  35.48 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1565  PilT domain-containing protein  37.5 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2598  PilT domain-containing protein  34.62 
 
 		 124 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0709656  normal  0.0156021 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4034  PilT protein-like  36.21 
 
 		 128 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.507909 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3737  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 		 128 aa  41.2  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0465  PilT domain-containing protein  38.89 
 
 		 125 aa  41.2  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0690648  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1434  PilT protein-like  37.74 
 
 		 125 aa  40.8  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.536835  normal  0.658173 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4123  PilT protein domain protein  46.3 
 
 		 126 aa  40  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.454937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>