44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_1745 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_1745  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  270  7e-72  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.111971 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3791  PilT domain-containing protein  39.81 
 
 
131 aa  91.3  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0127598 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4194  PilT domain-containing protein  38.89 
 
 
131 aa  90.1  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.82082  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4717  PilT domain-containing protein  38.89 
 
 
131 aa  90.1  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.603511 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2032  PilT domain-containing protein  39.62 
 
 
136 aa  85.1  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2268  PilT protein-like  35 
 
 
136 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.375245  normal  0.653218 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4553  PilT protein-like  34.02 
 
 
142 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0286007  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4312  PilT protein-like  34.02 
 
 
142 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.693301  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4269  PilT protein, N-terminal  35.87 
 
 
136 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.692119  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0660  hypothetical protein  35.58 
 
 
129 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.246636  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1720  PilT protein domain protein  34.91 
 
 
129 aa  63.2  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1068  PilT protein domain protein  38.78 
 
 
133 aa  62.4  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.741251  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2220  PilT protein domain protein  32.41 
 
 
131 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2398  PilT domain-containing protein  35.45 
 
 
132 aa  60.5  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1056  PilT protein domain protein  29 
 
 
130 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0434852 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1939  PilT protein domain protein  31.07 
 
 
134 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0767  PilT protein-like  31.68 
 
 
128 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.351411  normal  0.156815 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0608  PilT protein domain protein  31.68 
 
 
131 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.332384  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4123  PilT protein domain protein  36.67 
 
 
126 aa  50.1  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.454937  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12844  hypothetical protein  31.19 
 
 
134 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000370352  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2422  hypothetical protein  28.87 
 
 
128 aa  47  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1949  PilT protein domain protein  31.11 
 
 
128 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0280  hypothetical protein  29.55 
 
 
128 aa  44.7  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1408  PilT protein domain protein  29.73 
 
 
127 aa  44.7  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.748056  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1428  PilT protein domain protein  26.73 
 
 
132 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2346  PilT protein domain protein  27.27 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0465  PilT domain-containing protein  27.78 
 
 
125 aa  43.5  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0690648  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3678  hypothetical protein  28.89 
 
 
94 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.36052  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6344  PilT protein, N-terminal  30 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000192359  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1292  hypothetical protein  27.18 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4034  PilT protein-like  31.18 
 
 
128 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.507909 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3737  PilT domain-containing protein  25 
 
 
128 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0628  PilT domain-containing protein  30.1 
 
 
129 aa  42  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.478987  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3824  PilT protein-like  29.13 
 
 
129 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0706  PilT domain-containing protein  29.13 
 
 
129 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.816914  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3503  hypothetical protein  28.18 
 
 
124 aa  41.6  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000000742258  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1565  PilT domain-containing protein  27.47 
 
 
128 aa  41.2  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1038  PilT domain-containing protein  26.42 
 
 
128 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.442383 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0277  hypothetical protein  26.53 
 
 
131 aa  41.2  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0011733  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2648  PilT domain-containing protein  27.96 
 
 
129 aa  40.4  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0721441 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0413  PIN domain protein  26.17 
 
 
125 aa  40  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.688316  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0993  PilT protein-like  31.46 
 
 
128 aa  40  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00952696 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2529  PilT protein domain protein  29.36 
 
 
130 aa  40  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0576  hypothetical protein  26.17 
 
 
125 aa  40  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>