57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2636 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2636  PilT protein-like  100 
 
 		 129 aa  254  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2220  PilT protein domain protein  37.4 
 
 		 131 aa  83.6  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4269  PilT protein, N-terminal  36.64 
 
 		 136 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.692119  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3791  PilT domain-containing protein  40.46 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0127598 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12844  hypothetical protein  35.83 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000370352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4717  PilT domain-containing protein  42.42 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.603511 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4194  PilT domain-containing protein  42.42 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.82082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0121  PilT protein domain protein  36.36 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1720  PilT protein domain protein  39.5 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0660  hypothetical protein  39.17 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.246636  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2398  PilT domain-containing protein  40.15 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4312  PilT protein-like  35.54 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.693301  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4553  PilT protein-like  35.54 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0286007  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1457  PilT protein domain protein  34.59 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.739604  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3632  PilT protein domain protein  32.31 
 
 		 129 aa  53.5  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0706  PilT domain-containing protein  37.61 
 
 		 129 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.816914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0628  PilT domain-containing protein  37.61 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.478987  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1949  PilT protein domain protein  32.54 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3687  PilT domain-containing protein  35.9 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000701912 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1939  PilT protein domain protein  28.57 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1187  PilT protein domain protein  36.44 
 
 		 132 aa  51.2  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0967234  normal  0.700283 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3824  PilT protein-like  37.19 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6684  PilT protein domain protein  32.2 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.185489  normal  0.593771 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2947  PilT domain-containing protein  31.9 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.438865  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2333  PilT protein-like  31.9 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0303174  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2968  PilT domain-containing protein  31.9 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.691799 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3715  PilT domain-containing protein  30.95 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0601342 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3327  PilT protein domain protein  33.61 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0576  hypothetical protein  38.02 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0413  PIN domain protein  38.02 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.688316  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1292  hypothetical protein  29.17 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0608  PilT protein domain protein  30.58 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.332384  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2680  PilT protein domain protein  30.25 
 
 		 128 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2909  PilT protein domain protein  33.61 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1573  PIN domain protein  32.2 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1056  PilT protein domain protein  26.67 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0434852 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2648  PilT domain-containing protein  36.89 
 
 		 129 aa  44.3  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0721441 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6344  PilT protein, N-terminal  33.05 
 
 		 125 aa  44.3  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000192359  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3503  hypothetical protein  33.62 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000000742258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0047  PilT protein domain protein  31.5 
 
 		 128 aa  43.9  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0465  PilT domain-containing protein  28.78 
 
 		 125 aa  43.9  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0690648  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1598  PilT protein domain protein  34.62 
 
 		 130 aa  43.5  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4089  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4056  PilT domain-containing protein  34.17 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4956  PilT protein domain protein  32.2 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00799325 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0205  PilT protein domain protein  31.3 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.696325  normal  0.132115 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1068  PilT protein domain protein  32.8 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.741251  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0280  hypothetical protein  28.24 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4034  PilT protein-like  26.02 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.507909 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4018  hypothetical protein  34.65 
 
 		 131 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0671  PilT domain-containing protein  29.13 
 
 		 125 aa  42  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4573  PilT protein domain protein  23.73 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.152026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00629  PilT protein domain protein  29.06 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000365497  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6299  PilT protein-like  30.17 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3367  PilT protein domain protein  35.54 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.014061 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2032  PilT domain-containing protein  27.13 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4684  hypothetical protein  34.74 
 
 		 129 aa  40.4  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319794  normal  0.0555217 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2712  PilT protein domain protein  33.06 
 
 		 124 aa  40.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.162006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>