18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0626 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0626  hypothetical protein  100 
 
 		 87 aa  171  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0608  PilT protein domain protein  39.74 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.332384  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1720  PilT protein domain protein  41.77 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0660  hypothetical protein  40.51 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.246636  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1939  PilT protein domain protein  36.71 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1292  hypothetical protein  40 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4717  PilT domain-containing protein  43.37 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.603511 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3791  PilT domain-containing protein  40.96 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0127598 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4194  PilT domain-containing protein  43.37 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.82082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2032  PilT domain-containing protein  41.79 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00629  PilT protein domain protein  32.56 
 
 		 128 aa  47.4  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000365497  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0118  PilT protein-like protein  37.66 
 
 		 127 aa  47.4  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12844  hypothetical protein  34.62 
 
 		 134 aa  47  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000370352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1068  PilT protein domain protein  40 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.741251  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4269  PilT protein, N-terminal  41.54 
 
 		 136 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.692119  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2598  PilT domain-containing protein  37.5 
 
 		 124 aa  41.6  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0709656  normal  0.0156021 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3503  hypothetical protein  41.82 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000000742258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2442  PilT domain-containing protein  36.51 
 
 		 124 aa  40.4  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0388394  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>