58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3942 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3942  PilT protein domain protein  100 
 
 		 152 aa  315  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3991  PilT protein domain protein  97.37 
 
 		 152 aa  308  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.10183 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5182  PilT domain-containing protein  44.52 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27524  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2505  PilT protein-like  45.21 
 
 		 147 aa  144  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00228638  normal  0.384652 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1337  PilT protein domain protein  33.1 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.1325  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2936  PilT domain-containing protein  33.09 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.203821 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0688  PilT domain-containing protein  30.82 
 
 		 132 aa  62  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2127  vapC protein, putative  32 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3558  PilT domain-containing protein  28.77 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1848  PilT protein domain protein  31.72 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5055  PilT domain-containing protein  28.26 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1067  PilT protein domain protein  25.17 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0151  PilT protein domain protein  30.66 
 
 		 137 aa  57  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.85559  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0602  PilT protein domain protein  27.52 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191075  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2777  PilT protein domain protein  29.05 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1769  hypothetical protein  25.69 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8106  PilT protein domain protein  28.57 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0478  virulence-associated protein, putative  28.57 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0638  PilT protein domain protein  28.57 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3905  PilT domain-containing protein  27.94 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1325  nucleic acid binding protein  30.41 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000354508  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1433  NtrR protein  27.4 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4014  PilT protein domain protein  29.14 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00102621  hitchhiker  0.000259631 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2468  PilT protein domain protein  32 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0500169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1904  PilT protein domain protein  29.77 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0898  PilT protein domain protein  23.13 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.185586  normal  0.0272728 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2061  PilT protein-like  30.66 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.464796 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2669  PilT protein-like  28.68 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0691561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0058  PilT protein domain protein  27.94 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4624  PilT domain-containing protein  26.17 
 
 		 136 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.723585  normal  0.112001 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3269  PilT protein-like  27.7 
 
 		 133 aa  50.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159462  hitchhiker  0.00995267 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2951  PilT domain-containing protein  30.15 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3267  plasmid maintenance protein  27.41 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3368  plasmid maintenance protein  27.41 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.911  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1045  virulence-associated protein, putative  27.21 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.491192  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0894  PilT protein, N-terminal  27.21 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1868  PilT domain-containing protein  25.93 
 
 		 133 aa  48.9  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000212984  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3988  PilT protein domain protein  28.47 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0532731 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2366  PilT protein domain protein  26.67 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4187  DNA replication protein-like protein  26.97 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0305  PilT protein domain protein  25.74 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0032427  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2129  virulence-associated protein, putative  28.89 
 
 		 136 aa  47.4  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0156283  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1788  PilT protein domain protein  28.89 
 
 		 136 aa  47.4  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.813085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3939  PilT protein domain protein  28.06 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2204  PilT protein domain protein  28.86 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4076  plamid maintenance protein  26.97 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0657  PilT protein domain protein  25 
 
 		 129 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1509  PilT domain-containing protein  25.55 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.203613  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3680  PilT protein domain protein  29.61 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0440  PilT protein-like  29.63 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000179252  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0701  PilT protein domain protein  29.25 
 
 		 136 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.528227 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1213  virulence associated protein C  25.55 
 
 		 138 aa  44.3  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1063  PilT protein domain protein  28.06 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.471234  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0728  PilT protein domain protein  29.93 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.741529  hitchhiker  0.0000801582 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1812  PilT domain-containing protein  23.7 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.034692  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3757  PilT domain-containing protein  24.32 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272094  normal  0.0228653 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1771  hypothetical protein  25.74 
 
 		 133 aa  40.8  0.007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3968  PilT domain-containing protein  22.45 
 
 		 135 aa  40.8  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.10464  normal  0.34904 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>