40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_5182 on replicon NC_009973
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009973  Haur_5182  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 149 aa  308  1e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27524  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2505  PilT protein-like  48.63 
 
 		 147 aa  154  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00228638  normal  0.384652 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3942  PilT protein domain protein  44.52 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3991  PilT protein domain protein  42.47 
 
 		 152 aa  139  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.10183 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1848  PilT protein domain protein  35.17 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2936  PilT domain-containing protein  32.37 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.203821 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1337  PilT protein domain protein  31.85 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.1325  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1067  PilT protein domain protein  31.11 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1904  PilT protein domain protein  33.59 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0286  PilT protein domain protein  29.5 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.024358  decreased coverage  0.0024847 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2366  PilT protein domain protein  31.25 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5055  PilT domain-containing protein  30.56 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3988  PilT protein domain protein  28.37 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0532731 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2127  vapC protein, putative  25.17 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1213  virulence associated protein C  29.53 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0898  PilT protein domain protein  28.26 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.185586  normal  0.0272728 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1812  PilT domain-containing protein  29.37 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.034692  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3939  PilT protein domain protein  28.26 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1319  PilT protein domain protein  31.16 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3905  PilT domain-containing protein  29.53 
 
 		 134 aa  50.8  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0827  PilT protein domain protein  29.06 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471695 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1433  NtrR protein  29.29 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0305  PilT protein domain protein  26.62 
 
 		 128 aa  47.8  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0032427  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3558  PilT domain-containing protein  32.14 
 
 		 128 aa  47  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2669  PilT protein-like  29.67 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0691561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1868  PilT domain-containing protein  25.9 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000212984  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3269  PilT protein-like  27.14 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159462  hitchhiker  0.00995267 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2472  virulence associated protein C  26.53 
 
 		 133 aa  44.7  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00148493  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8106  PilT protein domain protein  28.67 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0478  virulence-associated protein, putative  25.9 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0638  PilT protein domain protein  25.9 
 
 		 136 aa  44.3  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0151  PilT protein domain protein  30.43 
 
 		 137 aa  43.9  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.85559  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0688  PilT domain-containing protein  25.19 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1623  virulence associated protein VagD, putative  29.36 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1771  hypothetical protein  23.13 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0657  PilT protein domain protein  27.74 
 
 		 129 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2951  PilT domain-containing protein  28.78 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2597  PilT protein-like protein  27.66 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0602  PilT protein domain protein  25.9 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191075  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1840  PilT domain-containing protein  25.23 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>