20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0598 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0598  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 136 aa  272  1.0000000000000001e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0817305  normal  0.249428 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0589  PilT protein domain protein  98.53 
 
 		 136 aa  270  7e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.663237  normal  0.0136168 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1159  PilT protein domain protein  31.82 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.876268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1751  PilT domain-containing protein  29.85 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0754903  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0232  PilT protein domain protein  36.22 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.363167 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11593  hypothetical protein  34.56 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.69589e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12566  hypothetical protein  31.2 
 
 		 137 aa  52  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.342692  normal  0.114809 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0280  PilT domain-containing protein  34.38 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.4278  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2527  PilT protein domain protein  31.36 
 
 		 131 aa  47  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0946  PilT domain-containing protein  27.74 
 
 		 135 aa  45.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000374994  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3128  PilT protein domain protein  30.23 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0420  PilT protein domain protein  29.69 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1454  PilT protein-like  29.63 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2435  PilT protein-like  29.46 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.790296  normal  0.0974853 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1138  PilT domain-containing protein  28 
 
 		 133 aa  42.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0838  PilT domain-containing protein  28.81 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.533625 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1213  virulence associated protein C  29.69 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12568  hypothetical protein  27.2 
 
 		 125 aa  40.4  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.724019  normal  0.141761 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1522  PilT-like protein  32.03 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4984  PilT protein domain protein  31.43 
 
 		 139 aa  40.4  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.599937  normal  0.921394 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>