20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0990 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0990  PilT protein-like  100 
 
 
131 aa  269  1e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286661 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2527  PilT protein domain protein  50.39 
 
 
131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1884  PilT domain-containing protein  48.09 
 
 
131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000144315  normal  0.966588 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2254  PilT domain-containing protein  46.46 
 
 
133 aa  114  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.366148  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0838  PilT domain-containing protein  50 
 
 
131 aa  114  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.533625 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0413  PilT protein-like  41.22 
 
 
133 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0550  PilT protein domain protein  44.96 
 
 
130 aa  105  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3708  PilT protein domain protein  43.41 
 
 
129 aa  98.2  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0520444 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2435  PilT protein-like  40.8 
 
 
132 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.790296  normal  0.0974853 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4104  PilT protein-like  32.58 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.393493  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11593  hypothetical protein  32.82 
 
 
134 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.69589e-19  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1669  PilT protein domain protein  33.59 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.47893  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1522  PilT-like protein  38.71 
 
 
135 aa  62  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12042  hypothetical protein  31.5 
 
 
132 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3128  PilT protein domain protein  33.9 
 
 
130 aa  62  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0280  PilT domain-containing protein  31.67 
 
 
133 aa  58.9  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.4278  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0232  PilT protein domain protein  28.81 
 
 
135 aa  50.8  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.363167 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4984  PilT protein domain protein  30.65 
 
 
139 aa  50.4  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.599937  normal  0.921394 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1159  PilT protein domain protein  28.35 
 
 
132 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.876268  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0197  PilT domain-containing protein  26.87 
 
 
126 aa  45.1  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>