17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0197 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0197  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 126 aa  246  8e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0413  PilT protein-like  32.56 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0838  PilT domain-containing protein  31.25 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.533625 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2254  PilT domain-containing protein  35.43 
 
 		 133 aa  53.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.366148  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1669  PilT protein domain protein  25.78 
 
 		 138 aa  52  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.47893  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2527  PilT protein domain protein  27.27 
 
 		 131 aa  50.4  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1751  PilT domain-containing protein  31.03 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0754903  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0550  PilT protein domain protein  32.41 
 
 		 130 aa  48.9  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0990  PilT protein-like  28.36 
 
 		 131 aa  47.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286661 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1522  PilT-like protein  27.69 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5766  PilT protein domain protein  27.34 
 
 		 126 aa  43.9  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.300152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1884  PilT domain-containing protein  26.92 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000144315  normal  0.966588 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1578  PIN domain protein  27.05 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0937354  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0280  PilT domain-containing protein  31.09 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.4278  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1289  PilT protein domain protein  26.23 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.745821  unclonable  0.0000000000204533 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0229  PilT protein domain protein  26.23 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1159  PilT protein domain protein  29.37 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.876268  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>