29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0067 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0067  PilT protein domain protein  100 
 
 		 138 aa  281  1.0000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1224  PilT protein domain protein  40.16 
 
 		 141 aa  97.1  7e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2577  hypothetical protein  32.59 
 
 		 137 aa  95.9  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.165592  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0366  PilT domain-containing protein  33.08 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.732059 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2141  PilT protein domain protein  33.58 
 
 		 154 aa  79.3  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.976499 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0236  PilT domain-containing protein  31.58 
 
 		 136 aa  78.6  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5555  PilT protein domain protein  26.4 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2686  PilT protein domain protein  31.34 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.645615  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0698  PilT domain-containing protein  29.55 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0099  PilT protein domain protein  29.01 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.24947 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0123  PilT protein domain protein  28.79 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11160  hypothetical protein  33.83 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.359613 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0300  hypothetical protein  32 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.372415  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26830  hypothetical protein  33.05 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0177  PilT domain-containing protein  30.88 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.872264  normal  0.455576 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0026  PilT protein domain protein  26.55 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0119  hypothetical protein  24.44 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0483151  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0887  PilT domain-containing protein  22.38 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000631126  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4811  Phycobilisome protein  24.39 
 
 		 306 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1173  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0475965  normal  0.164371 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24240  hypothetical protein  25.38 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2306  PilT domain-containing protein  28.21 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131604 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13700  PIN domain protein  21.37 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0621  PilT domain-containing protein  28.68 
 
 		 148 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0550538 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0375  PilT domain-containing protein  31.11 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0957  hypothetical protein  23.77 
 
 		 139 aa  41.2  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000165315  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0561  PilT protein domain protein  25.56 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.183955  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3102  PilT protein domain protein  25.56 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3424  PilT protein domain protein  27.84 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>