42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1987 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1987  PilT protein domain protein  100 
 
 		 138 aa  282  1.0000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000443268  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2481  nucleic-acid-binding protein contains PIN domain-like protein  88.97 
 
 		 136 aa  253  4e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0197  Nucleotide binding protein PINc  84.96 
 
 		 136 aa  240  6e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000623662  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3234  PilT protein domain protein  40.31 
 
 		 138 aa  102  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3493  PilT domain-containing protein  35.94 
 
 		 136 aa  98.6  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0375  PilT domain-containing protein  40 
 
 		 137 aa  99  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0621  PilT protein domain protein  33.59 
 
 		 134 aa  85.9  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63227  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1205  PilT protein domain protein  35.16 
 
 		 134 aa  84.3  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00010263  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0561  PilT protein domain protein  34.38 
 
 		 149 aa  83.6  7e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.183955  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3102  PilT protein domain protein  34.38 
 
 		 149 aa  83.6  7e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2996  PilT protein domain protein  36.29 
 
 		 135 aa  77  0.00000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.190317  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1941  PilT protein domain protein  41.41 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1214  hypothetical protein  35.54 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000226808 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1056  PilT protein domain protein  31.45 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0770997  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1522  PilT protein domain protein  35.38 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3426  hypothetical protein  29.23 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3222  hypothetical protein  29.23 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.333438  normal  0.638176 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0315  PilT domain-containing protein  30.4 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2399  PilT protein domain protein  31.36 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.108207  decreased coverage  0.00132588 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0661  Pil-like protein  30.15 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1698  PilT domain-containing protein  27.35 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.249544  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3176  hypothetical protein  27.27 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4164  PilT domain-containing protein  27.07 
 
 		 139 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0375778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2443  hypothetical protein  25.42 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3352  PilT domain-containing protein  27.07 
 
 		 139 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4815  PilT protein-like  27.07 
 
 		 140 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830494  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3023  PilT domain-containing protein  28.33 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0615  hypothetical protein  29.41 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.466526  normal  0.0181742 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1153  hypothetical protein  26.05 
 
 		 133 aa  51.6  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.948383  normal  0.0186046 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5676  hypothetical protein  28.93 
 
 		 132 aa  51.2  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.304221 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1077  hypothetical protein  24.58 
 
 		 133 aa  50.4  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.918095  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03477  PilT-like protein  28.68 
 
 		 146 aa  50.4  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00890  predicted nucleic-acid-binding protein, contains PIN domain protein  31.97 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0587  PilT protein domain protein  30 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1277  hypothetical protein  27.12 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.836734  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0275  hypothetical protein  25.19 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3084  PilT protein  30.25 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3693  PilT protein-like  24.24 
 
 		 130 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4258  PilT domain-containing protein  23.97 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25020  predicted nucleic-acid-binding protein, contains PIN domain  26.45 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1340  PilT protein-like  25.81 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0194017 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0658  PilT protein domain protein  25.96 
 
 		 151 aa  40.4  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0680222  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>