41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0197 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_0197  Nucleotide binding protein PINc  100 
 
 		 136 aa  275  2e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000623662  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1987  PilT protein domain protein  84.96 
 
 		 138 aa  240  6e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000443268  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2481  nucleic-acid-binding protein contains PIN domain-like protein  85.19 
 
 		 136 aa  239  9e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3234  PilT protein domain protein  41.09 
 
 		 138 aa  99  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3493  PilT domain-containing protein  35.16 
 
 		 136 aa  99  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0375  PilT domain-containing protein  40.46 
 
 		 137 aa  99  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1205  PilT protein domain protein  36.72 
 
 		 134 aa  84.7  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00010263  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0621  PilT protein domain protein  33.59 
 
 		 134 aa  84  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63227  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0561  PilT protein domain protein  32.56 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.183955  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2996  PilT protein domain protein  39.37 
 
 		 135 aa  82  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.190317  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3102  PilT protein domain protein  32.56 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1214  hypothetical protein  37.19 
 
 		 125 aa  81.3  0.000000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000226808 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1941  PilT protein domain protein  42.37 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1056  PilT protein domain protein  32.26 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0770997  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3426  hypothetical protein  30.23 
 
 		 134 aa  67  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3222  hypothetical protein  30.23 
 
 		 134 aa  67  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.333438  normal  0.638176 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1522  PilT protein domain protein  32.82 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2399  PilT protein domain protein  31.36 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.108207  decreased coverage  0.00132588 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0315  PilT domain-containing protein  30.4 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0615  hypothetical protein  30.33 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.466526  normal  0.0181742 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0661  Pil-like protein  28.68 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3176  hypothetical protein  27.69 
 
 		 132 aa  52.8  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5676  hypothetical protein  29.41 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.304221 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3023  PilT domain-containing protein  27.5 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03477  PilT-like protein  29.41 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2443  hypothetical protein  25.83 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0587  PilT protein domain protein  31.11 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4164  PilT domain-containing protein  25.58 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0375778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3352  PilT domain-containing protein  25.58 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4815  PilT protein-like  25.58 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830494  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00890  predicted nucleic-acid-binding protein, contains PIN domain protein  31.15 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0275  hypothetical protein  27.48 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3084  PilT protein  30.25 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1153  hypothetical protein  21.01 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.948383  normal  0.0186046 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1698  PilT domain-containing protein  21.37 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.249544  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3693  PilT protein-like  25.83 
 
 		 130 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1277  hypothetical protein  23.73 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.836734  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24970  predicted nucleic-acid-binding protein, contains PIN domain  25.2 
 
 		 134 aa  42  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1077  hypothetical protein  20.34 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.918095  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2205  PilT protein domain protein  26.36 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000141921 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3501  PilT protein-like  24.17 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>