37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_24970 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_24970  predicted nucleic-acid-binding protein, contains PIN domain  100 
 
 		 134 aa  261  3e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25020  predicted nucleic-acid-binding protein, contains PIN domain  63.43 
 
 		 134 aa  160  8.000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3176  hypothetical protein  45.24 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2443  hypothetical protein  41.6 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4164  PilT domain-containing protein  40.44 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0375778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4815  PilT protein-like  40.44 
 
 		 140 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830494  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3352  PilT domain-containing protein  40.44 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5676  hypothetical protein  36.43 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.304221 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3010  PilT protein-like  35.07 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0615  hypothetical protein  38.84 
 
 		 136 aa  67  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.466526  normal  0.0181742 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1698  PilT domain-containing protein  32.26 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.249544  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4258  PilT domain-containing protein  37.01 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2285  PilT protein-like protein  39.32 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.420791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3023  PilT domain-containing protein  37.29 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2132  PilT protein domain protein  35.29 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1277  hypothetical protein  36.29 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.836734  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3084  PilT protein  39.5 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03477  PilT-like protein  32.65 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1077  hypothetical protein  33.87 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.918095  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0275  hypothetical protein  31.93 
 
 		 132 aa  60.1  0.000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3013  PilT domain-containing protein  37.19 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1917  PilT protein domain protein  35.54 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.209239  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1340  PilT protein-like  35.04 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0194017 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2544  PilT protein-like  35.25 
 
 		 136 aa  57  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0661  Pil-like protein  34.65 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3501  PilT protein-like  31.25 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3693  PilT protein-like  32.82 
 
 		 130 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3493  PilT domain-containing protein  32.33 
 
 		 136 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1522  PilT protein domain protein  27.48 
 
 		 147 aa  51.2  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1153  hypothetical protein  35.2 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.948383  normal  0.0186046 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2481  nucleic-acid-binding protein contains PIN domain-like protein  25.2 
 
 		 136 aa  47  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4208  hypothetical protein  38.57 
 
 		 89 aa  45.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.435376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0197  Nucleotide binding protein PINc  25.2 
 
 		 136 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000623662  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0561  PilT protein domain protein  27.97 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.183955  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3102  PilT protein domain protein  27.97 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3234  PilT protein domain protein  29.37 
 
 		 138 aa  40.8  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1056  PilT protein domain protein  23.33 
 
 		 136 aa  40.4  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0770997  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>