42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0561 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_0561  PilT protein domain protein  100 
 
 		 149 aa  307  2.9999999999999997e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.183955  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3102  PilT protein domain protein  100 
 
 		 149 aa  307  2.9999999999999997e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3234  PilT protein domain protein  46.67 
 
 		 138 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0621  PilT protein domain protein  41.98 
 
 		 134 aa  110  7.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63227  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1205  PilT protein domain protein  39.69 
 
 		 134 aa  107  6e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00010263  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0375  PilT domain-containing protein  40 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2481  nucleic-acid-binding protein contains PIN domain-like protein  35.94 
 
 		 136 aa  90.9  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1522  PilT protein domain protein  35.29 
 
 		 147 aa  87.4  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1987  PilT protein domain protein  34.38 
 
 		 138 aa  83.6  8e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000443268  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3493  PilT domain-containing protein  33.6 
 
 		 136 aa  83.6  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0197  Nucleotide binding protein PINc  32.56 
 
 		 136 aa  82.4  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000623662  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1056  PilT protein domain protein  34.55 
 
 		 136 aa  79.3  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0770997  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2443  hypothetical protein  34.75 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2399  PilT protein domain protein  28.24 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.108207  decreased coverage  0.00132588 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1698  PilT domain-containing protein  35.04 
 
 		 133 aa  64.7  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.249544  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0587  PilT protein domain protein  37.37 
 
 		 101 aa  64.7  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25020  predicted nucleic-acid-binding protein, contains PIN domain  34.15 
 
 		 134 aa  62  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0315  PilT domain-containing protein  31.65 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3084  PilT protein  26.83 
 
 		 129 aa  57  0.00000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1214  hypothetical protein  28.21 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000226808 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0661  Pil-like protein  32.09 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2996  PilT protein domain protein  29.84 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.190317  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1153  hypothetical protein  32.52 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.948383  normal  0.0186046 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3222  hypothetical protein  35.19 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.333438  normal  0.638176 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3426  hypothetical protein  35.19 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1077  hypothetical protein  31.67 
 
 		 133 aa  50.8  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.918095  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3023  PilT domain-containing protein  30.25 
 
 		 128 aa  50.4  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1941  PilT protein domain protein  29.03 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1277  hypothetical protein  30.51 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.836734  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4815  PilT protein-like  27.27 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830494  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4164  PilT domain-containing protein  27.27 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0375778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3352  PilT domain-containing protein  27.27 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4258  PilT domain-containing protein  30.53 
 
 		 132 aa  44.3  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2205  PilT protein domain protein  23.53 
 
 		 138 aa  43.9  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000141921 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0615  hypothetical protein  28.44 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.466526  normal  0.0181742 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2285  PilT protein-like protein  30.77 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.420791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3010  PilT protein-like  24.59 
 
 		 131 aa  42  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2132  PilT protein domain protein  30 
 
 		 130 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0067  PilT protein domain protein  25.56 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24970  predicted nucleic-acid-binding protein, contains PIN domain  27.97 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1340  PilT protein-like  32.14 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0194017 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5676  hypothetical protein  28.85 
 
 		 132 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.304221 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>