33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03477 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03477  PilT-like protein  100 
 
 		 146 aa  298  1e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3176  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5676  hypothetical protein  31.94 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.304221 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2443  hypothetical protein  31.65 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2544  PilT protein-like  39.42 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24970  predicted nucleic-acid-binding protein, contains PIN domain  32.65 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3023  PilT domain-containing protein  29.93 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4258  PilT domain-containing protein  29.86 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1340  PilT protein-like  31.34 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0194017 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25020  predicted nucleic-acid-binding protein, contains PIN domain  29.73 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0615  hypothetical protein  29.37 
 
 		 136 aa  53.5  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.466526  normal  0.0181742 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3013  PilT domain-containing protein  29.85 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2132  PilT protein domain protein  28.81 
 
 		 130 aa  53.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3693  PilT protein-like  30.71 
 
 		 130 aa  52  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0197  Nucleotide binding protein PINc  29.41 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000623662  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1698  PilT domain-containing protein  35 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.249544  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0275  hypothetical protein  34.74 
 
 		 132 aa  51.6  0.000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3501  PilT protein-like  29.29 
 
 		 130 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0661  Pil-like protein  32.19 
 
 		 136 aa  51.2  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1987  PilT protein domain protein  28.68 
 
 		 138 aa  50.4  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000443268  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3084  PilT protein  30.97 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1917  PilT protein domain protein  33.67 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.209239  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2481  nucleic-acid-binding protein contains PIN domain-like protein  28.68 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4815  PilT protein-like  25.69 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830494  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1153  hypothetical protein  29.5 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.948383  normal  0.0186046 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4164  PilT domain-containing protein  25.69 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0375778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3352  PilT domain-containing protein  25.69 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2285  PilT protein-like protein  28.87 
 
 		 133 aa  47  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.420791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3493  PilT domain-containing protein  25.37 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2996  PilT protein domain protein  24.14 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.190317  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1056  PilT protein domain protein  25.17 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0770997  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1522  PilT protein domain protein  25.23 
 
 		 147 aa  44.3  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2399  PilT protein domain protein  23.7 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.108207  decreased coverage  0.00132588 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>