43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2481 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_2481  nucleic-acid-binding protein contains PIN domain-like protein  100 
 
 		 136 aa  276  7e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1987  PilT protein domain protein  88.97 
 
 		 138 aa  253  4e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000443268  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0197  Nucleotide binding protein PINc  85.19 
 
 		 136 aa  239  9e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000623662  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3234  PilT protein domain protein  42.64 
 
 		 138 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3493  PilT domain-containing protein  35.16 
 
 		 136 aa  101  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0375  PilT domain-containing protein  40.46 
 
 		 137 aa  100  5e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0561  PilT protein domain protein  35.94 
 
 		 149 aa  90.9  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.183955  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3102  PilT protein domain protein  35.94 
 
 		 149 aa  90.9  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0621  PilT protein domain protein  34.38 
 
 		 134 aa  87  8e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63227  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1205  PilT protein domain protein  35.16 
 
 		 134 aa  85.9  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00010263  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2996  PilT protein domain protein  38.89 
 
 		 135 aa  82.8  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.190317  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1056  PilT protein domain protein  31.45 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0770997  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1941  PilT protein domain protein  40.62 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1214  hypothetical protein  35.54 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000226808 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1522  PilT protein domain protein  34.38 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3426  hypothetical protein  30 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3222  hypothetical protein  30 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.333438  normal  0.638176 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2399  PilT protein domain protein  31.36 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.108207  decreased coverage  0.00132588 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1698  PilT domain-containing protein  26.5 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.249544  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0315  PilT domain-containing protein  30.4 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0661  Pil-like protein  31.34 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3176  hypothetical protein  27.48 
 
 		 132 aa  57  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0615  hypothetical protein  30.88 
 
 		 136 aa  57  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.466526  normal  0.0181742 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1153  hypothetical protein  26.89 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.948383  normal  0.0186046 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0587  PilT protein domain protein  31.52 
 
 		 101 aa  55.1  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2443  hypothetical protein  25.42 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3023  PilT domain-containing protein  27.5 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1077  hypothetical protein  25.42 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.918095  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4164  PilT domain-containing protein  26.15 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0375778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3352  PilT domain-containing protein  26.15 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5676  hypothetical protein  27.73 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.304221 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4815  PilT protein-like  26.15 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830494  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00890  predicted nucleic-acid-binding protein, contains PIN domain protein  32.79 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1277  hypothetical protein  27.97 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.836734  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03477  PilT-like protein  28.68 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24970  predicted nucleic-acid-binding protein, contains PIN domain  25.2 
 
 		 134 aa  47  0.00009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0275  hypothetical protein  25.95 
 
 		 132 aa  47  0.00009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25020  predicted nucleic-acid-binding protein, contains PIN domain  25.21 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3084  PilT protein  29.41 
 
 		 129 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3693  PilT protein-like  25.83 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2285  PilT protein-like protein  28.21 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.420791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2205  PilT protein domain protein  28.46 
 
 		 138 aa  40.4  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000141921 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3501  PilT protein-like  25 
 
 		 130 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>