26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0315 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0315  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 138 aa  278  2e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0375  PilT domain-containing protein  34.38 
 
 		 137 aa  84.7  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1056  PilT protein domain protein  32.82 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0770997  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3234  PilT protein domain protein  31.45 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2996  PilT protein domain protein  29.27 
 
 		 135 aa  63.5  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.190317  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1987  PilT protein domain protein  30.4 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000443268  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3493  PilT domain-containing protein  31.09 
 
 		 136 aa  62  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1522  PilT protein domain protein  27.07 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0197  Nucleotide binding protein PINc  30.4 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000623662  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2481  nucleic-acid-binding protein contains PIN domain-like protein  30.4 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1941  PilT protein domain protein  31.45 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0621  PilT protein domain protein  30.08 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63227  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1205  PilT protein domain protein  27.91 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00010263  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0561  PilT protein domain protein  31.65 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.183955  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3102  PilT protein domain protein  31.65 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2399  PilT protein domain protein  33.08 
 
 		 147 aa  50.4  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.108207  decreased coverage  0.00132588 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2205  PilT protein domain protein  24.79 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000141921 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25020  predicted nucleic-acid-binding protein, contains PIN domain  31.06 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3426  hypothetical protein  29.17 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3222  hypothetical protein  29.17 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.333438  normal  0.638176 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4164  PilT domain-containing protein  26.02 
 
 		 139 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0375778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3352  PilT domain-containing protein  26.02 
 
 		 139 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4815  PilT protein-like  26.02 
 
 		 140 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830494  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2575  PilT domain-containing protein  27.2 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1534  PilT domain-containing protein  22.03 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.281833  normal  0.0745617 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1917  PilT protein domain protein  26.83 
 
 		 133 aa  40.4  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.209239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>