37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0375 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0375  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 137 aa  280  3.0000000000000004e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3234  PilT protein domain protein  43.51 
 
 		 138 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3102  PilT protein domain protein  40 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0561  PilT protein domain protein  40 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.183955  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2481  nucleic-acid-binding protein contains PIN domain-like protein  40.46 
 
 		 136 aa  100  5e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0197  Nucleotide binding protein PINc  40.46 
 
 		 136 aa  99  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000623662  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1987  PilT protein domain protein  40 
 
 		 138 aa  99  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000443268  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0621  PilT protein domain protein  35.82 
 
 		 134 aa  94  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63227  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1056  PilT protein domain protein  38.21 
 
 		 136 aa  89  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0770997  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1205  PilT protein domain protein  33.58 
 
 		 134 aa  87.8  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00010263  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0315  PilT domain-containing protein  34.38 
 
 		 138 aa  84.7  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3493  PilT domain-containing protein  36.07 
 
 		 136 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2996  PilT protein domain protein  34.65 
 
 		 135 aa  78.6  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.190317  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1214  hypothetical protein  36.22 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000226808 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3222  hypothetical protein  32.81 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.333438  normal  0.638176 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3426  hypothetical protein  32.81 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1522  PilT protein domain protein  33.09 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2399  PilT protein domain protein  37.14 
 
 		 147 aa  63.5  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.108207  decreased coverage  0.00132588 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2443  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3084  PilT protein  34.43 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0587  PilT protein domain protein  34.74 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1941  PilT protein domain protein  28.93 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1340  PilT protein-like  33.88 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0194017 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25020  predicted nucleic-acid-binding protein, contains PIN domain  31.01 
 
 		 134 aa  51.6  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3023  PilT domain-containing protein  28.46 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2132  PilT protein domain protein  32.5 
 
 		 130 aa  51.2  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2285  PilT protein-like protein  34.19 
 
 		 133 aa  50.1  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.420791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4815  PilT protein-like  28.69 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830494  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4164  PilT domain-containing protein  28.69 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0375778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3352  PilT domain-containing protein  28.69 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4258  PilT domain-containing protein  28.46 
 
 		 132 aa  47.8  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0615  hypothetical protein  33.59 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.466526  normal  0.0181742 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1917  PilT protein domain protein  31.85 
 
 		 133 aa  45.1  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.209239  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0067  PilT protein domain protein  31.11 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5676  hypothetical protein  26.21 
 
 		 132 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.304221 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2544  PilT protein-like  28.93 
 
 		 136 aa  40.8  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1430  hypothetical protein  41.67 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.443392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>