42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4258 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4258  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 132 aa  269  9e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4164  PilT domain-containing protein  51.15 
 
 		 139 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0375778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3352  PilT domain-containing protein  51.15 
 
 		 139 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4815  PilT protein-like  51.15 
 
 		 140 aa  137  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830494  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2285  PilT protein-like protein  46.15 
 
 		 133 aa  110  9e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.420791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3010  PilT protein-like  35.11 
 
 		 131 aa  84.3  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0615  hypothetical protein  37.59 
 
 		 136 aa  80.9  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.466526  normal  0.0181742 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5676  hypothetical protein  35.04 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.304221 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1153  hypothetical protein  37.59 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.948383  normal  0.0186046 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1077  hypothetical protein  42.06 
 
 		 133 aa  77  0.00000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.918095  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2443  hypothetical protein  38.71 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25020  predicted nucleic-acid-binding protein, contains PIN domain  40.94 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0661  Pil-like protein  35.38 
 
 		 136 aa  73.6  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3493  PilT domain-containing protein  33.05 
 
 		 136 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3176  hypothetical protein  41.79 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2132  PilT protein domain protein  35.54 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1698  PilT domain-containing protein  31.3 
 
 		 133 aa  70.1  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.249544  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3501  PilT protein-like  32.8 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3084  PilT protein  34.62 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1277  hypothetical protein  37.1 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.836734  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3693  PilT protein-like  33.06 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1340  PilT protein-like  36.75 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0194017 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24970  predicted nucleic-acid-binding protein, contains PIN domain  37.01 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2544  PilT protein-like  34.88 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03477  PilT-like protein  29.86 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1917  PilT protein domain protein  35.2 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.209239  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3013  PilT domain-containing protein  37.4 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1056  PilT protein domain protein  25.81 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0770997  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0275  hypothetical protein  33.06 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1522  PilT protein domain protein  27.91 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4208  hypothetical protein  36.25 
 
 		 89 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.435376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2399  PilT protein domain protein  27.56 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.108207  decreased coverage  0.00132588 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0375  PilT domain-containing protein  28.46 
 
 		 137 aa  47.8  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3234  PilT protein domain protein  27.64 
 
 		 138 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1214  hypothetical protein  26.5 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000226808 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0561  PilT protein domain protein  30.53 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.183955  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3102  PilT protein domain protein  30.53 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3023  PilT domain-containing protein  42.59 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1987  PilT protein domain protein  23.97 
 
 		 138 aa  43.9  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000443268  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2205  PilT protein domain protein  28.57 
 
 		 138 aa  42.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000141921 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0621  PilT protein domain protein  28.18 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63227  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2996  PilT protein domain protein  28 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.190317  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>