42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1077 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1077  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  263  5.999999999999999e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.918095  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1277  hypothetical protein  76.34 
 
 		 133 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.836734  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1698  PilT domain-containing protein  56.06 
 
 		 133 aa  157  5e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.249544  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1153  hypothetical protein  57.46 
 
 		 133 aa  152  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.948383  normal  0.0186046 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3352  PilT domain-containing protein  39.52 
 
 		 139 aa  85.9  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4164  PilT domain-containing protein  39.52 
 
 		 139 aa  85.9  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0375778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4815  PilT protein-like  39.52 
 
 		 140 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830494  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4258  PilT domain-containing protein  42.06 
 
 		 132 aa  80.5  0.000000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3084  PilT protein  34.4 
 
 		 129 aa  73.6  0.0000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2443  hypothetical protein  30.77 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24970  predicted nucleic-acid-binding protein, contains PIN domain  33.87 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3493  PilT domain-containing protein  32.2 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25020  predicted nucleic-acid-binding protein, contains PIN domain  34.68 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5676  hypothetical protein  31.25 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.304221 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0661  Pil-like protein  37.31 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3176  hypothetical protein  34.35 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3010  PilT protein-like  32.26 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3693  PilT protein-like  28.68 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3102  PilT protein domain protein  31.67 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0561  PilT protein domain protein  31.67 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.183955  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0615  hypothetical protein  31.2 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.466526  normal  0.0181742 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0275  hypothetical protein  31.15 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2481  nucleic-acid-binding protein contains PIN domain-like protein  25.42 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3023  PilT domain-containing protein  34.75 
 
 		 128 aa  53.5  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2544  PilT protein-like  30.4 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3501  PilT protein-like  31.06 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1987  PilT protein domain protein  24.58 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000443268  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2285  PilT protein-like protein  31.62 
 
 		 133 aa  50.8  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.420791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1522  PilT protein domain protein  26.67 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1917  PilT protein domain protein  32.81 
 
 		 133 aa  48.1  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.209239  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1056  PilT protein domain protein  31.39 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0770997  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2132  PilT protein domain protein  38.36 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3234  PilT protein domain protein  26.27 
 
 		 138 aa  47.4  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2205  PilT protein domain protein  24.58 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000141921 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1340  PilT protein-like  41.67 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0194017 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03477  PilT-like protein  27.4 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3013  PilT domain-containing protein  32 
 
 		 133 aa  43.5  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0197  Nucleotide binding protein PINc  20.34 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000623662  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0621  PilT protein domain protein  26.45 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63227  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1205  PilT protein domain protein  25.62 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00010263  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1214  hypothetical protein  27.78 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000226808 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1941  PilT protein domain protein  29.03 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>