47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4815 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_4815  PilT protein-like  100 
 
 		 140 aa  283  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830494  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3352  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 139 aa  280  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4164  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 139 aa  280  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0375778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4258  PilT domain-containing protein  51.15 
 
 		 132 aa  137  6e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2285  PilT protein-like protein  48.48 
 
 		 133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.420791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0615  hypothetical protein  37.5 
 
 		 136 aa  93.6  9e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.466526  normal  0.0181742 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1153  hypothetical protein  43.2 
 
 		 133 aa  90.5  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.948383  normal  0.0186046 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3010  PilT protein-like  39.69 
 
 		 131 aa  84  7e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1077  hypothetical protein  39.52 
 
 		 133 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.918095  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1277  hypothetical protein  41.13 
 
 		 133 aa  81.6  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.836734  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1698  PilT domain-containing protein  34.09 
 
 		 133 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.249544  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2132  PilT protein domain protein  40.5 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24970  predicted nucleic-acid-binding protein, contains PIN domain  40.44 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2443  hypothetical protein  35.61 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2544  PilT protein-like  34.53 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5676  hypothetical protein  30.3 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.304221 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25020  predicted nucleic-acid-binding protein, contains PIN domain  37.8 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1340  PilT protein-like  41.88 
 
 		 136 aa  67  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0194017 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3084  PilT protein  38.89 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0661  Pil-like protein  34.07 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3501  PilT protein-like  34.88 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3693  PilT protein-like  33.33 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3176  hypothetical protein  36.09 
 
 		 132 aa  62  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1917  PilT protein domain protein  37.6 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.209239  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3013  PilT domain-containing protein  35.48 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3023  PilT domain-containing protein  35.54 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3493  PilT domain-containing protein  29.66 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1056  PilT protein domain protein  25 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0770997  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1987  PilT protein domain protein  27.07 
 
 		 138 aa  52.8  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000443268  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1214  hypothetical protein  29.91 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000226808 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1522  PilT protein domain protein  29.69 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2481  nucleic-acid-binding protein contains PIN domain-like protein  26.15 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0275  hypothetical protein  29.37 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2399  PilT protein domain protein  31.75 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.108207  decreased coverage  0.00132588 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0375  PilT domain-containing protein  28.69 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0197  Nucleotide binding protein PINc  25.58 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000623662  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03477  PilT-like protein  25.69 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3234  PilT protein domain protein  29.27 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0561  PilT protein domain protein  27.27 
 
 		 149 aa  47  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.183955  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3102  PilT protein domain protein  27.27 
 
 		 149 aa  47  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2996  PilT protein domain protein  27.78 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.190317  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00890  predicted nucleic-acid-binding protein, contains PIN domain protein  25.4 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0621  PilT protein domain protein  27.2 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63227  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0587  PilT protein domain protein  28.57 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0315  PilT domain-containing protein  26.02 
 
 		 138 aa  41.6  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4208  hypothetical protein  35.44 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.435376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1205  PilT protein domain protein  29.37 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00010263  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>