39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1056 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1056  PilT protein domain protein  100 
 
 		 136 aa  277  3e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0770997  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3493  PilT domain-containing protein  38.17 
 
 		 136 aa  91.7  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0375  PilT domain-containing protein  38.21 
 
 		 137 aa  89  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3234  PilT protein domain protein  34.15 
 
 		 138 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3102  PilT protein domain protein  34.55 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0561  PilT protein domain protein  34.55 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.183955  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2481  nucleic-acid-binding protein contains PIN domain-like protein  31.45 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0197  Nucleotide binding protein PINc  32.26 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000623662  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1987  PilT protein domain protein  31.45 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000443268  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2399  PilT protein domain protein  30.77 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.108207  decreased coverage  0.00132588 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0315  PilT domain-containing protein  32.82 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2996  PilT protein domain protein  29.77 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.190317  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1522  PilT protein domain protein  34.4 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0621  PilT protein domain protein  28.69 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63227  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4258  PilT domain-containing protein  25.81 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1941  PilT protein domain protein  28.23 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1214  hypothetical protein  26.47 
 
 		 125 aa  57  0.00000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000226808 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1205  PilT protein domain protein  27.87 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00010263  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1340  PilT protein-like  31.93 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0194017 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4815  PilT protein-like  25 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830494  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4164  PilT domain-containing protein  25 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0375778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3352  PilT domain-containing protein  25 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2544  PilT protein-like  30.58 
 
 		 136 aa  53.5  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1698  PilT domain-containing protein  25 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.249544  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2443  hypothetical protein  24.79 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3023  PilT domain-containing protein  25.64 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0661  Pil-like protein  26.02 
 
 		 136 aa  47  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2205  PilT protein domain protein  22.76 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000141921 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1917  PilT protein domain protein  28.1 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.209239  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03477  PilT-like protein  25.17 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1153  hypothetical protein  25.41 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.948383  normal  0.0186046 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1077  hypothetical protein  27.27 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.918095  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0615  hypothetical protein  24.17 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.466526  normal  0.0181742 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5676  hypothetical protein  19.8 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.304221 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2132  PilT protein domain protein  22.31 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3084  PilT protein  25.83 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2558  PilT protein domain protein  25.95 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1277  hypothetical protein  26.5 
 
 		 133 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.836734  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24970  predicted nucleic-acid-binding protein, contains PIN domain  23.33 
 
 		 134 aa  40.4  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>