37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1205 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_1205  PilT protein domain protein  100 
 
 
134 aa  274  3e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00010263  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0621  PilT protein domain protein  88.81 
 
 
134 aa  251  2.0000000000000002e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63227  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0561  PilT protein domain protein  39.69 
 
 
149 aa  107  6e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.183955  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3102  PilT protein domain protein  39.69 
 
 
149 aa  107  6e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3234  PilT protein domain protein  38.24 
 
 
138 aa  89.7  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0375  PilT domain-containing protein  33.58 
 
 
137 aa  87.8  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2481  nucleic-acid-binding protein contains PIN domain-like protein  35.16 
 
 
136 aa  85.9  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0197  Nucleotide binding protein PINc  36.72 
 
 
136 aa  84.7  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000623662  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1987  PilT protein domain protein  35.16 
 
 
138 aa  84.3  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000443268  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1522  PilT protein domain protein  34.85 
 
 
147 aa  84  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3493  PilT domain-containing protein  32.31 
 
 
136 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2399  PilT protein domain protein  36.64 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.108207  decreased coverage  0.00132588 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2996  PilT protein domain protein  34.45 
 
 
135 aa  64.7  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.190317  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0587  PilT protein domain protein  35.79 
 
 
101 aa  61.6  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0315  PilT domain-containing protein  27.91 
 
 
138 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1056  PilT protein domain protein  27.87 
 
 
136 aa  55.5  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0770997  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3084  PilT protein  34.69 
 
 
129 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1214  hypothetical protein  28.93 
 
 
125 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000226808 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3222  hypothetical protein  27.2 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.333438  normal  0.638176 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3426  hypothetical protein  27.2 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2443  hypothetical protein  29.63 
 
 
132 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2205  PilT protein domain protein  29.27 
 
 
138 aa  52  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000141921 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1340  PilT protein-like  35.38 
 
 
136 aa  51.2  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0194017 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1153  hypothetical protein  25.6 
 
 
133 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.948383  normal  0.0186046 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1698  PilT domain-containing protein  27.12 
 
 
133 aa  47.4  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.249544  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2155  hypothetical protein  25.81 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1941  PilT protein domain protein  26.89 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2544  PilT protein-like  34.69 
 
 
136 aa  45.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0334  PilT protein-like  28.8 
 
 
135 aa  43.5  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184149  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2285  PilT protein-like protein  36 
 
 
133 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.420791  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2132  PilT protein domain protein  28.57 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0661  Pil-like protein  30.63 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1430  hypothetical protein  41.67 
 
 
100 aa  41.2  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.443392  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4164  PilT domain-containing protein  29.37 
 
 
139 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0375778  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3352  PilT domain-containing protein  29.37 
 
 
139 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4815  PilT protein-like  29.37 
 
 
140 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830494  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1077  hypothetical protein  25.62 
 
 
133 aa  40.4  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.918095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>